Obecné specifikace: Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut labore et dolore magna aliqua.
Specifikace prostředí: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor
incididunt ut labore et dolore magna aliqua.

certifikace: Lorem ipsum dolor sit amet,
consectetur adipiscing elita. Sed do eiusmod tempor incididunt ut
labore et dolore magna aliqua.
sériové číslo: XXX-XXXX-XXXX

Návod k použití produktu:

1. Instalace a kalibrace přístroje:

Postupujte podle kroků uvedených v příručce pro pipetu a chapadlo
instalace.

2. Přemístění:

Pro krátké pohyby viz část 2.5 v návodu. Pro
pohyby na dlouhé vzdálenosti, postupujte podle uvedených pokynů. Obecné stěhování
k dispozici je také poradenství.

3. Připojení:

Zajistěte správné připojení napájení, jak je popsáno v návodu.
Podle potřeby připojte USB a přídavná zařízení. Síťová připojení
by měly být stanoveny podle pokynů.

4. Návrhář protokolu:

Pochopte požadavky na Návrhář protokolu a zjistěte, jak na to
navrhnout nové protokoly nebo upravit stávající podle vaší laboratoře
požadavky.

5. Python Protocol API:

Prozkoumejte psaní a spouštění skriptů pomocí Python Protocol API.
Objevte exkluzivní funkce Pythonu pro vylepšené funkce.

6. Protokoly OT-2:

Přečtěte si o protokolech OT-2 Python, protokolech OT-2 JSON a
Protokoly magnetického modulu pro různé typy experimentů.

Často kladené otázky (FAQ):

Otázka: Jak mohu odstranit problémy, pokud se robot nepohybuje jako?
očekávaný?

A: Zkontrolujte připojení napájení, zajistěte správnou kalibraci
přístrojů a ověřte, že v něm nejsou žádné překážky
cesta robota.

Otázka: Mohu s Opentrons Flex používat vlastní pipety?

Odpověď: Společnost Opentrons doporučuje pro optimální použití kompatibilní pipety
výkon a přesnost.

“`

View Fullscreen

Opentrons Flex
Návod k použití
Opentrons Labworks Inc.
prosince 2023

© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Registrované názvy, ochranné známky atd. použité v tomto dokumentu, i když nejsou jako takové výslovně označeny, nelze považovat za nechráněné zákonem.

Obsah
Předmluva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Struktura této příručky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Poznámky a varování . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Kapitola 1 Úvod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Vítejte v Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Co je nového ve Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Pracovní stanice Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Bezpečnostní informace . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Bezpečnostní symboly. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Varování o elektrické bezpečnosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Další bezpečnostní upozornění . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Bezpečnostní upozornění . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Biologická bezpečnost . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Toxické výpary . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Hořlavé kapaliny . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Soulad s předpisy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Bezpečnost . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Elektromagnetická kompatibilita . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Varování a poznámky FCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Kanadská shoda s ISED . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Upozornění na životní prostředí . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Předběžná certifikace Wi-Fi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Kapitola 2: Instalace a přemístění . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Bezpečnostní a provozní požadavky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Kam umístit Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Spotřeba energie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Podmínky prostředí . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Rozbalení . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Požadované úsilí a čas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Přepravka a balicí materiál . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Prvky produktu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Část 1: Vyjmutí přepravky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Část 2: Uvolněte Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Část 3: Konečná montáž a zapnutí . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32

2.3 První spuštění . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Zapnutí . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Připojení k síti nebo počítači . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Instalace aktualizací softwaru . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Připojení přívěsku nouzového zastavení . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Dejte svému robotovi jméno . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Instalace a kalibrace přístroje . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Instalace pipety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Instalace chapadla . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Přemístění . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Krátké pohyby. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Pohyby na dlouhé vzdálenosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Všeobecné rady ohledně stěhování . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Závěrečné úvahy o stěhování. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Kapitola 3: Popis systému. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Fyzické součásti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Rám a kryt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Plošina a pracovní plocha . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Stagoblast . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Upevnění paluby. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Skluz na odpad. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49 Stagsloty oblasti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Pohybový systém . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Dotyková obrazovka a LED displeje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Specifikace pipety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Kalibrace pipety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Adaptér stojanu na špičky pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Částečné vyzvednutí špičky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipetové senzory. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Aktualizace firmwaru pipety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Chapadlo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Specifikace chapadla . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Kalibrace chapadla . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Aktualizace firmwaru gripperu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Přívěsek nouzového zastavení . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Kdy použít nouzové zastavení . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Zapnutí a uvolnění nouzového zastavení . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60

3.5 Připojení . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Připojení napájení . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB a pomocná připojení . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Síťová připojení . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Specifikace systému. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Obecné specifikace . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Specifikace prostředí . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Certifikace. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Sériové číslo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Kapitola 4: Moduly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Podporované moduly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Modulový nosičový systém . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Kalibrace modulu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Kdy kalibrovat moduly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Jak kalibrovat moduly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Modul ohřívače-třepačky GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Funkce Heater-Shaker. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Specifikace ohřívače-třepačky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Magnetický blok GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Vlastnosti magnetického bloku. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Specifikace magnetického bloku . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Teplotní modul GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Vlastnosti teplotního modulu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Specifikace teplotního modulu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Modul termocykleru GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Vlastnosti termocykleru . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Specifikace termocykleru . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Kapitola 5: Labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Koncepce laboratorního softwaru. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware jako hardware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware jako data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Vlastní laboratorní software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Nádrže . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Jednojamkové zásobníky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Vícejamkové zásobníky. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Zásobníky a definice API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Zakázkové laboratorní vybavení nádrží. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Desky s jamkami . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83

6-jamkové destičky. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12jamkových destiček . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24jamkových destiček . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 48jamkových destiček. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96jamkových destiček . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384jamkových destiček . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Adaptéry na desku studny. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Destičky s jamkami a definice API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Zakázkové laboratorní vybavení jamkové destičky. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Špičky a držáky na špičky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Stojany na špičky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Kompatibilita trysek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Adaptér držáku špiček . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Zkumavky a stojany na zkumavky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Kombinace trubek a stojanů . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stojany na 6 trubek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stojany na 10 zkumavek. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stojany na 15 trubek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Stojany na 24 trubek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Definice API stojanu na zkumavky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Zakázkové laboratorní vybavení trubkových stojanů . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Hliníkové bloky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Plochá spodní deska . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 24jamkový hliníkový blok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 96jamkový hliníkový blok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Samostatné adaptéry . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Kombinace hliníkových blokových laboratorních přístrojů . . . . . . . . . . . . . . . .94 24jamkové kombinace laboratorních přístrojů z hliníkového bloku . . . . . . . . .95 96jamkové kombinace laboratorních přístrojů z hliníkového bloku . . . . . . . . .95 5.7 Labware a Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Vlastní definice labwaru . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Vytváření vlastních definic labwaru . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 Schéma laboratorního softwaru JSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 Definice laboratorního softwaru JSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Kapitola 6: Vývoj protokolu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Předem připravené protokoly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Knihovna protokolů . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Služba vývoje uživatelských protokolů . . . . . . . . . . . . . . . .

6.2 Návrhář protokolu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Požadavky na návrháře protokolu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Návrh protokolu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Úprava existujících protokolů . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 Python Protocol API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Psaní a spouštění skriptů . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Funkce exkluzivní pro Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 Protokoly OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Python protokoly. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 Protokoly OT-2 JSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Protokoly magnetického modulu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Kapitola 7: Software a provoz. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Ovládání dotykové obrazovky. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Přístrojová deska robota . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Správa protokolů . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Podrobnosti protokolu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Spuštění nastavení . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Kontrola polohy Labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Průběh běhu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Dokončení běhu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Správa přístrojů. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Nastavení robota. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Konfigurace decku . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Aplikace Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Instalace aplikace . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Přenos protokolů do Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Stav modulu a ovládací prvky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Poslední spuštění protokolu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Pokročilé ovládání . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyter Notebook . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Operace příkazového řádku přes SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Kapitola 8: Údržba a servis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Čištění vašeho Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Než začnete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Co lze vyčistit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Čisticí roztoky. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Čištění rámu a okenních výplní . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Čištění paluby . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148

Čištění portálů. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Čištění odpadního skluzu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Čištění pipet a špiček . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Dekontaminace pipetou . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Čištění špiček pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Čištění chapadla . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Čisticí moduly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Obecné čištění modulu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Těsnění termocykleru. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Laboratorní vybavení bezpečné v autoklávu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Servis Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Služby Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Kvalifikace instalace a provozní kvalifikace . . . 155 Preventivní údržba . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Záruka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Příloha A: Slovník . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Dodatek B: Dodatečná dokumentace . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Centrum znalostí Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Dokumentace rozhraní API protokolu Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Reference HTTP API Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Dokumentace pro vývojáře . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Dodatek C: Software s otevřeným zdrojovým kódem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons na GitHubu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Ostatní úložiště . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Dodatek D: Podpora a kontaktní informace . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Prodej . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 Podpora D.2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Obchodní informace . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177

Předmluva
Vítejte v návodu k obsluze robota pro manipulaci s kapalinami Opentrons Flex. Tato příručka vás provede téměř vším, co potřebujete vědět k nastavení a používání Flex, se zaměřením na témata, která jsou pro každodenní uživatele Flex v laboratorním prostředí nejrelevantnější.
Struktura tohoto návodu
Opentrons Flex je komplexní systém, takže existuje mnoho různých cest, jak se naučit vše, co umí. Neváhejte a skočte rovnou na kapitolu, která se zabývá jakýmkoli tématem, které vás zajímá! NapřampPokud již máte ve své laboratoři nastaven Flex, můžete přeskočit kapitolu Instalace a přemístění.
Pokud dáváte přednost řízenému přístupu, je tato příručka strukturovaná, abyste ji mohli sledovat od začátku do konce.
Přečtěte si o tématu Flex. Charakteristické rysy Flex jsou uvedeny v kapitole 1: Úvod. Úvod také obsahuje důležité bezpečnostní a regulační informace.
Začněte s Flex. Pokud potřebujete nastavit Flex, postupujte podle podrobných pokynů v kapitole 2: Instalace a přemístění. Poté se seznamte s komponentami Flex v kapitole 3: Popis systému.
Nastavte si palubu. Konfigurace paluby umožňuje různé vědecké aplikace na Flex. Kapitola 4: Moduly popisuje periferní zařízení Opentrons, které můžete nainstalovat do nebo na horní část balíčku pro provádění specifických vědeckých úkolů. Kapitola 5: Labware vysvětluje, jak pracovat se zařízením pro uchovávání kapalin.
Spusťte protokol. Základním využitím Flex je spouštění standardizovaných vědeckých postupů, známých jako protokoly. Kapitola 6: Vývoj protokolů nabízí několik způsobů, jak získat hotové protokoly nebo je sami navrhnout. Chcete-li spustit svůj protokol, postupujte podle pokynů v kapitole 7: Software a provoz, která také obsahuje pokyny pro provádění dalších úkolů a přizpůsobení nastavení vašeho robota.
Udržujte Flex v chodu. Řiďte se radami v kapitole 8: Údržba a servis, aby byl váš Flex čistý a fungoval optimálně. Nebo se přihlaste do jedné z tam uvedených služeb Opentrons a nechte nás, abychom se o Flex postarali za vás.
Naučte se ještě více. Stále potřebujete něco jiného? Prostudujte si přílohy. Dodatek A: Glosář definuje termíny související s Flex. Dodatek B: Další dokumentace vás odkazuje na ještě více zdrojů pro produkty Opentrons a psaní kódu pro ovládání Flex.

OPENTRONS FLEX

PŘEDMLUVA
Příloha C: Software Open-Source vysvětluje, jak je software Opentrons hostován na GitHubu jako zdroj pro vývojáře i nevývojáře.
Příloha D: Podpora a kontaktní informace uvádí, jak se dostat do kontaktu s Opentrons, pokud potřebujete pomoc nad rámec toho, co poskytuje naše dokumentace.
Poznámky a varování
V této příručce naleznete speciálně formátované bloky poznámek a varování. Poznámky poskytují užitečné informace, které nemusí být při běžném používání Flex zřejmé. Zvláštní pozornost věnujte varováním – používají se pouze v situacích, kdy riskujete zranění, poškození zařízení, ztrátu nebo znehodnoceníamplátek nebo činidel, ztrátě dat nebo jinému poškození. Poznámky a varování vypadají takto:
Sample Poznámka: To je něco, co byste měli vědět, ale nepředstavuje to žádné nebezpečí.
Sample Varování: Toto je něco, co potřebujete vědět, protože je s tím spojeno riziko.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1
Zavedení

Tato kapitola vás seznámí s ekosystémem Opentrons Flex, včetně celkového návrhu systému a dostupných konfigurací pracovních stanic. Obsahuje také důležité informace o shodě a bezpečnosti, které byste měli opakovatview před nastavením robota Opentrons Flex. Další podrobnosti o funkcích Opentrons Flex naleznete v kapitole Popis systému.

1.1 Vítejte v Opentrons Flex
Opentrons Flex je robot pro manipulaci s kapalinami navržený pro vysokou propustnost a složité pracovní postupy. Robot Flex je základem modulárního systému, který zahrnuje pipety, uchopovač laboratorního vybavení, příslušenství na palubě, moduly na palubě a laboratorní vybavení – to vše si můžete sami vyměnit. Flex je navržen s dotykovou obrazovkou, takže s ním můžete pracovat přímo na laboratorním stole, nebo jej můžete ovládat z celé laboratoře pomocí aplikace Opentrons nebo našich open-source API.
Pracovní stanice Flex jsou dodávány s veškerým vybavením – robotem, hardwarem a laboratorním softwarem – které potřebujete, abyste mohli začít automatizovat běžné laboratorní úlohy. Pro ostatní aplikace běží Opentrons Flex na plně otevřeném softwaru a firmwaru a je agnostický vůči činidlům a laboratornímu softwaru, což vám dává kontrolu nad tím, jak navrhujete a spouštíte své protokoly.

Co je nového ve Flex
Opentrons Flex je součástí řady robotů Opentrons pro manipulaci s kapalinami. Uživatelé Opentrons Flex mohou být obeznámeni s Opentrons OT-2, naším osobním pipetovacím robotem. Flex překračuje možnosti OT-2 v několika klíčových oblastech a přináší vyšší propustnost a dobu průchodu.

Funkce Propustnost pipety
Kapacita pipety a špičky

Popis
Flex pipety mají 1, 8 nebo 96 kanálů. 96kanálová pipeta pracuje s 12krát větším počtem jamek najednou než největší pipeta OT-2.
Pipety Flex mají větší objemové rozsahy (1 µL, 50 µL) a všechny mohou pracovat s jakýmkoli objemem špiček Opentrons Flex. Jedná se o vylepšení oproti pipetám OT-5, které mají menší rozsahy a musí používat špičky s odpovídajícím rozsahem objemu.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1 ÚVOD

Chapadlo Automatická kalibrace Nosiče modulu dotykové obrazovky Souřadnice slotu na palubě Pohyblivý odpad Velikost a hmotnost

Opentrons Flex Gripper zvedne a posouvá laboratorní vybavení po desce automaticky, bez zásahu uživatele. Chapadlo umožňuje složitější pracovní postupy v rámci jednoho běhu protokolu.
Polohová kalibrace pipet Flex a chapadla je plně automatizovaná. Stiskněte jedno tlačítko a přístroj se přesune k přesně obrobeným bodům na palubě, aby určil svou přesnou polohu, přičemž tato data uloží pro použití ve vašich protokolech.
Flex má vlastní dotykové rozhraní, které vám umožňuje ovládat jej přímo, kromě použití aplikace Opentrons. Pomocí dotykové obrazovky můžete spustit protokoly, zkontrolovat stav úlohy a změnit nastavení přímo na robotu.
Flex moduly se hodí do nosičů, které zabírají prostor pod palubou. Caddies umístí vaše laboratorní vybavení blíže k povrchu paluby a umožní vedení kabelů pod palubou. Nosiče umožňují ještě více konfigurací modulů a laboratorního softwaru na palubě.
Sloty paluby na Flex jsou očíslovány souřadnicovým systémem (A1D4), který je podobný tomu, jak jsou číslovány jamky na laboratorním vybavení.
Odpadkový koš může být umístěn na více místech paluby na Flex. Výchozí umístění (slot A3) je doporučená poloha. Chapadlo můžete také použít k likvidaci odpadu ve volitelném odpadovém shozu.
Flex je o něco větší a mnohem těžší než OT-2. Instalační úlohy na Flex vyžadují asistenci laboratorního partnera.

Podrobné srovnání technických specifikací robotů je k dispozici na Opentrons webmísto.
Roboti Flex i OT-2 běží na našem open-source softwaru a aplikace Opentrons může ovládat oba typy robotů najednou. I když protokoly OT-2 nelze spouštět přímo na Flex, je snadné je přizpůsobit (podrobnosti najdete v části Protokoly OT-2 v kapitole Vývoj protokolů).

Flex pracovní stanice
Pracovní stanice Opentrons Flex zahrnují robota Flex, příslušenství, pipety a uchopovací zařízení, moduly na palubě a laboratorní software potřebné k automatizaci konkrétní aplikace. Všechny komponenty pracovní stanice jsou modulární. Pokud potřebujete změnit aplikace, můžete přidat nebo vyměnit jiný hardware Flex a kompatibilní spotřební materiál.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1 ÚVOD
PRACOVNÍ STANICE NGS
Opentrons Flex NGS Workstation automatizuje přípravu knihovny NGS. Dokáže zautomatizovat pracovní postupy předběžného sekvenování pomocí jakéhokoli předního systému reagencií, včetně fragmentace a tagpříprava knihovny založená na mentacích.
Kromě robota Flex obsahuje pracovní stanice NGS:
Gripper Volba konfigurace pipety
Dvě 8kanálové pipety (1 µL a 50 µL) 5kanálová pipeta (1000 µL) Teplotní modul s magnetickým blokem pro odpadní nálevku Modul termocykleru Labware kit s filtračními špičkami, mikrocentrifugačními zkumavkami, zásobníky a PCR destičkami
PRACOVNÍ STANICE PCR
Opentrons Flex PCR Workstation automatizuje nastavení PCR a termocyklování po dobu až 96 sekundamples. Může alikvotovat chlazená činidla a sampdo 96-jamkové PCR destičky. S přidáním automatického modulu termocykleru použijte uchopovač k vložení destičky do termocykleru a poté spusťte vybraný program PCR.
Kromě robota Flex obsahuje pracovní stanice PCR:
Gripper Volba konfigurace pipety
1-kanálová pipeta (1 µL) a 50-kanálová pipeta (8 µL) 1-kanálová pipeta (50 µL) Teplotní modul odpadního skluzu Labware kit s filtračními špičkami, mikrocentrifugačními zkumavkami, zásobníky a PCR destičkami

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1 ÚVOD
PRACOVNÍ STANICE EXTRAKCE NUKLEOVÝCH KYSELIN
Opentrons Flex Nucleic Acid Extraction Workstation automatizuje izolaci a purifikaci DNA/RNA. Používá magnetický blok pro separaci magnetických kuliček a Heater-Shaker pro sample lýze a resuspenze magnetických kuliček.
Kromě robota Flex obsahuje pracovní stanice pro extrakci nukleových kyselin:
Gripper Volba konfigurace pipety
1-kanálová pipeta (5 1000 µL) a 8-kanálová pipeta (5 1000 µL) 96-kanálová pipeta (5 1000 µL) Laboratorní souprava modulu ohřívače a třepačky s magnetickým blokem na odpad s filtračními špičkami, zásobníky, PCR destičkami a destičkami s hlubokými jamkami
PRACOVNÍ STANICE PRO ČIŠTĚNÍ PROTEINŮ MAGNETICKÝMI KROLÍČKY
Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation automatizuje čištění proteinů v malém měřítku a proteomiku.amppříprava až 96 samples. Je kompatibilní s mnoha oblíbenými činidly na bázi magnetických kuliček.
Kromě robota Flex obsahuje pracovní stanice Protein Purification Workstation:
Gripper Volba konfigurace pipety
1-kanálová pipeta (5 1000 µL) a 8-kanálová pipeta (5 1000 µL) 96-kanálová pipeta (5 1000 µL) Laboratorní souprava modulu ohřívače a třepačky s magnetickým blokem na odpad s filtračními špičkami, zásobníky, PCR destičkami a destičkami s hlubokými jamkami
PRACOVNÍ STANICE FLEX PREP
Opentrons Flex Prep Workstation automatizuje jednoduché pipetovací pracovní postupy. Nakonfigurujte pracovní stanici pomocí 1-kanálové a 8-kanálové pipety pro provádění úloh, jako je např.ample transfer, sample duplikace, a

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1 ÚVOD
alikvotování činidla. Nakonfigurujte pracovní stanici pomocí 96-kanálové pipety pro provádění vysoce výkonného alikvotování reagencií a míchání destičekampIng.
Kromě robota Flex obsahuje pracovní stanice Flex Prep:
Volba konfigurace pipety: 1-kanálová pipeta (5 µL) a 1000-kanálová pipeta (8 µL) 5-kanálová pipeta (1000 µL)
Sada laboratorního vybavení s filtračními špičkami, mikrocentrifugačními zkumavkami a zásobníky
PLAZMIDOVÁ PŘÍPRAVA PRACOVIŠTĚ
Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation automatizuje pracovní postupy extrakce a čištění plazmidů na bázi magnetických kuliček. Tato pracovní stanice je vybavena velkoobjemovými pipetami, modulem Heater-Shaker a magnetickým blokem pro umístění většiny chemie na bázi perliček.
Kromě robota Flex obsahuje pracovní stanice Plasmid Prep Workstation:
Uchopovací 1-kanálová pipeta (5 µL) a 1000-kanálová pipeta (8 µL) Odpadní násypný nástavec Modul ohřívače a třepačky s magnetickým blokem Labware kit s filtračními špičkami, mikrocentrifugačními zkumavkami, zásobníky, PCR destičkami a destičkami s hlubokými jamkami
PRACOVNÍ STANICE SYNBIO
Opentrons Flex SynBio Workstation automatizuje řadu pracovních postupů syntetické biologie, jako je syntéza a klonování DNA. Využívá magnetický blok a teplotní modul pro podporu většiny chemie na bázi perliček. Přidejte modul termocykleru a provádějte inkubace s vyhřívaným víkem amplifikací.
Kromě robota Flex obsahuje pracovní stanice SynBio:
Gripper 1-kanálová pipeta (5 µL) a 1000-kanálová pipeta (8 µL) Modul teploty magnetického bloku

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1 ÚVOD

Sada laboratorního vybavení s běžnými a filtračními špičkami, mikrocentrifugačními zkumavkami, zásobníky, PCR destičkami a destičkami s hlubokými jamkami

1.2 Bezpečnostní informace
Robot pro manipulaci s kapalinami Opentrons Flex byl navržen pro bezpečný provoz. Chcete-li zajistit bezpečné používání vašeho Flex, přečtěte si specifikace a pokyny pro shodu v této části. Tyto pokyny pokrývají bezpečné používání vstupních a výstupních připojení pro produkt, včetně napájecích a datových připojení, a také výstražné štítky na robotu Flex a souvisejícím hardwaru. Použití zařízení jiným způsobem, než je uvedeno v tomto návodu, může ohrozit uživatele a zařízení.

Bezpečnostní symboly
Různé štítky na Flex a v této příručce vás varují před zdroji možného zranění nebo újmy.

Symbol

Popis
Varování: Upozorňuje uživatele na potenciálně nebezpečné podmínky. Činnosti, které mohou způsobit zranění nebo smrt.
Upozornění: Varuje uživatele před poškozením zařízení. Ztracená nebo poškozená data. Nenávratné přerušení prováděné operace.
Úraz elektrickým proudem: Označuje součásti přístroje, které mohou při nesprávném zacházení s přístrojem představovat riziko úrazu elektrickým proudem.

Horký povrch: Označuje součásti přístroje, které při nesprávné manipulaci s přístrojem představují riziko poranění osob v důsledku vysokých teplot/teplot.

Bod sevření: Identifikuje součásti nástroje, které mohou při pohybu představovat riziko zranění osob.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1 ÚVOD

Na Flex najdete následující štítky:
Štítky duševního vlastnictví Štítky shody s předpisy (např. ETL) Štítky s elektrickým nebezpečím Všeobecné výstražné štítky Štítky výrobků Štítky s bodem sevření High voltage štítky Štítky s jmenovitým výkonem

Varování o elektrické bezpečnosti
Vždy dodržujte následující elektrická bezpečnostní varování:

Symbol

Popis
Zapojte robota do uzemněného obvodu třídy 1. Viz část Připojení napájení v kapitole Popis systému.

Nepřipojujte (zapojujte), neodpojujte (neodpojujte) ani nepoužívejte napájecí kabely, pokud: Kabel je roztřepený nebo poškozený. Ostatní připojené kabely, šňůry nebo zásuvky jsou roztřepené nebo poškozené.
Použití poškozených napájecích kabelů může způsobit nebezpečí úrazu elektrickým proudem s následkem vážného zranění nebo poškození robota.
Nevyměňujte napájecí kabel střídavého proudu, pokud to není ve směru podpory Opentrons.

Další informace o elektrických požadavcích naleznete v části Spotřeba energie v kapitole Instalace a přemístění.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1 ÚVOD

Další bezpečnostní upozornění
Vždy dodržujte následující dodatečná bezpečnostní upozornění:

Symbol

Popis
Opentrons Flex nebyl certifikován pro použití s výbušnými nebo hořlavými kapalinami. Nevkládejte do robota talíře, zkumavky nebo lahvičky obsahující výbušné nebo hořlavé kapaliny ani jinak neprovozujte přístroj s výbušnými nebo hořlavými kapalinami v krytu.
Při práci s chemikáliemi používejte správnou laboratorní praxi a dodržujte opatření výrobce. Společnost Opentrons nenese odpovědnost ani neručí za žádné škody způsobené nebo v důsledku použití nebezpečných chemikálií.

Flex váží 88.5 kg (195 liber). V důsledku toho jej bezpečně zvednou a přemístí dva lidé. Viz část Přemístění v kapitole Instalace a přemístění.

Flex by měl být umístěn na povrch, který unese jeho hmotnost 88.5 kg (195 liber) s dostatečnou plochou pro umístění robota plus jeho minimální vzdálenost (20 cm/8 palců). Viz část Bezpečnostní a provozní požadavky v kapitole Instalace a přemístění.
Flex může během provozu vydávat vibrace. Umístěte robota na pevný, rovný a voděodolný povrch s příčnými výztuhami nebo svařovanými spoji. Viz část Bezpečnostní a provozní požadavky v kapitole Instalace a přemístění.

Bezpečnostní upozornění
Chcete-li chránit Flex před poškozením, dodržujte tato opatření:

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1 ÚVOD

Symbol

Popis
Používejte laboratorní software, který vyhovuje ANSI/SLAS nebo je schválen společností Opentrons. Viz kapitola Labware.
Udržujte korozivní materiály, činidla nebo jinak poškozující materiály mimo dosah robota.

Biologická bezpečnost
Se vzorky a reagenciemi obsahujícími materiály odebrané lidem zacházejte jako s potenciálně infekčními agens. Společnost Opentrons doporučuje používat bezpečné laboratorní postupy, jak je vysvětleno v Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL) 6th Edition.
Za normálních okolností Flex nevytváří detekovatelné aerosoly ze zdrojových kapalin. Za určitých podmínek je však možné vytvářet aerosoly ze zdrojových kapalin. Při provozu se zdrojovými kapalinami úrovně biologické bezpečnosti 2 nebo vyšší zvažte provedení opatření proti expozici aerosolu v souladu s místními regulačními orgány. Chcete-li minimalizovat potenciální riziko expozice aerosolu z robota, ujistěte se, že:
Proveďte údržbu, jak je popsáno v kapitole Údržba a servis. Řádně nainstalujte a zajistěte všechny kryty přístrojů, pipety, moduly a laboratorní vybavení. Používejte správnou pipetovací techniku, která pomůže snížit množství aerosolů.
Toxické výpary
Pokud pracujete s těkavými rozpouštědly nebo toxickými látkami, použijte účinný laboratorní ventilační systém k odstranění veškerých výparů, které mohou vznikat.
Hořlavé kapaliny
Flex nebyl hodnocen pro použití s hořlavými kapalinami a neměl by být používán s hořlavými kapalinami.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1 ÚVOD

1.3 Soulad s předpisy
Opentrons Flex splňuje všechny příslušné požadavky následujících bezpečnostních a elektromagnetických norem.

Bezpečnost
ID pravidla IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051

Titul
Bezpečnostní požadavky na elektrická zařízení pro měření, řízení a laboratorní použití Část 1: Obecné požadavky
Zvláštní požadavky na laboratorní vybavení pro míchání a míchání

Elektromagnetická kompatibilita

ID pravidla EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Část 15 Hlava B Třída A IC ICES-003

Titul
Elektrická zařízení pro měření, řízení a laboratorní použití Požadavky EMC Část 1: Obecné požadavky Neúmyslné radiátory
Správa spektra a vybavení způsobující rušení telekomunikací Standardní vybavení informačních technologií (včetně digitálních přístrojů)

Varování a poznámky FCC
Varování: Změny nebo úpravy této jednotky, které nejsou výslovně schváleny společností Opentrons, mohou zrušit oprávnění uživatele provozovat zařízení.
Toto zařízení vyhovuje části 15 pravidel FCC. Provoz podléhá následujícímu:

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 1 ÚVOD
Toto zařízení nesmí způsobovat škodlivé rušení. Toto zařízení musí akceptovat jakékoli přijaté rušení, včetně rušení, které může způsobit nežádoucí
operace.
Poznámka: Toto zařízení bylo testováno a bylo zjištěno, že vyhovuje omezením pro digitální zařízení třídy A podle části 15 pravidel FCC. Tyto limity jsou navrženy tak, aby poskytovaly přiměřenou ochranu proti škodlivému rušení, když je zařízení provozováno v komerčním prostředí. Toto zařízení generuje, používá a může vyzařovat vysokofrekvenční energii a pokud není nainstalováno a používáno v souladu s návodem k použití, může způsobovat škodlivé rušení rádiové komunikace. Provoz tohoto zařízení v obytné oblasti pravděpodobně způsobí škodlivé rušení a v takovém případě bude uživatel požádán, aby rušení na vlastní náklady odstranil.
Kanada shoda s ISED
Kanada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Tento produkt splňuje příslušné technické specifikace Innovation, Science and Economic Development Canada.
Současný produkt je v souladu s technickými specifikacemi aplikovatelnými pro d'Innovation, Sciences et Développement économique Canada.
Environmentální varování
Varování: Rakovina a poškození reprodukce www.P65Warnings.ca.gov
Předcertifikace Wi-Fi
Wi-Fi modul je předem certifikován pro použití v mnoha regionech:
Spojené státy americké (FCC): Identifikátor FCC UAY-W8997-M1216 Evropský hospodářský prostor (CE): Žádný veřejný identifikátor (vlastní prohlášení) Kanada (IC): Identifikační číslo verze hardwaru W8997-M1216 Japonsko (TELEC): Certifikované číslo 020-170034 Indie (WPC): Registrační číslo ETA-SD-20191005525 (vlastní prohlášení)

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2
Instalace a přemístění
Tato kapitola popisuje, jak připravit svou laboratoř na Opentrons Flex, jak nastavit robota a jak jej v případě potřeby přesunout. Před převzetím vašeho Flex se ujistěte, že vaše laboratoř nebo zařízení splňuje všechna kritéria v části Bezpečnostní a provozní požadavky. Když nastane čas uvést váš Flex do provozu, postupujte podle podrobných pokynů v částech Vybalení, První spuštění a Instalace a kalibrace přístroje nebo použijte službu Opentrons Onsite Support Set Up. A pokud budete někdy potřebovat přesunout svůj Flex na nové místo, blízko nebo daleko, postupujte podle kroků v části Přemístění.
2.1 Bezpečnostní a provozní požadavky
Kam umístit Opentrons Flex
Prostor je cennou komoditou téměř v každé laboratoři. Váš Flex bude něco potřebovat – ale ne příliš mnoho, protože je navržen tak, aby se vešel na polovinu standardní laboratorní lavice. Ujistěte se, že máte prostor, který splňuje následující kritéria.
Povrch lavice: Stacionární, robustní, rovný, voděodolný povrch. Stoly nebo lavice s kolečky (i aretačními kolečky) se nedoporučují. Flex se pohybuje rychle a má velkou hmotnost, která může otřást nebo narušit rovnováhu lehkých nebo pohyblivých stolů.
Nosnost: Samotný robot váží 88.5 kg (195 lb) a měli by ho zvedat pouze dvě osoby, které spolupracují. Umístěte robota na povrch, který pohotově unese jeho hmotnost a hmotnost všech modulů, laboratorního vybavení, kapalin nebo jiného laboratorního vybavení, které chcete použít ve svých aplikacích.
Operační prostor: Rozměry základny robota jsou 87 cm Š x 69 cm H x 84 cm V (asi 34″ x 27″ x 33″). Flex potřebuje 20 cm (8″) bočního a zadního prostoru pro kabely, připojení USB a pro odvádění výfukových plynů z modulů, které se zahřívají a chladí.
Varování: Neumisťujte boční nebo zadní stranu Flex do jedné roviny se stěnou.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ

84 cm 33″

87 cm 34″
Rozměry základny Opentrons Flex.

69 cm 27″

20 cm 8″

Nahoru view Opentrons Flex s minimální boční a zadní vůlí.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ

Spotřeba energie
Opentrons Flex by měl být připojen k zásuvce ve zdi nebo poblíž místa, kde jej instalujete. Flex připojujte pouze k obvodům, které dokážou pojmout maximální spotřebu energie:
Vstupní výkon: 36 VDC, 6.1 A Spotřeba při nečinnosti: 30 W Typická spotřeba: 40 W (během protokolu) Maximální spotřeba: Přibližně 50 W
Přesná spotřeba energie závisí na:
Množství a typ pohybu provedeného během protokolu. Doba, po kterou robot tráví nečinnost. Stav světel na robotu. Kolik nástrojů je připojeno.
Nezapomeňte vzít v úvahu další elektroniku, která spotřebovává energii na stejném okruhu, včetně modulů Flex s vlastními napájecími zdroji. NapřampModul Thermocycler má maximální spotřebu energie (630 W), která je mnohem větší než samotný robot Flex. V případě potřeby se poraďte s manažerem vašeho zařízení, abyste se ujistili, že splňuje požadavky na napájení vašeho zařízení.

Podmínky prostředí
Podmínky prostředí pro doporučené použití, přijatelné použití a skladování se liší:

Doporučeno pro provoz systému

Přijatelné pro provoz systému

Okolní teplota +20 až +25 °C

+2 až +40 °C

Relativní vlhkost Nadmořská výška

40 %, nekondenzující
Přibližně 500 m nad mořem

30 %, nekondenzující (pod 80 °C)
Až 2000 m nad mořem

Skladování a přeprava
-10 až +60 °C
10 %, nekondenzující (pod 85 °C)
Až 2000 m nad mořem

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
Společnost Opentrons ověřila výkon Opentrons Flex v podmínkách doporučených pro provoz systému a provoz v těchto podmínkách by měl poskytovat optimální výsledky. Flex je bezpečné používat v podmínkách přijatelných pro provoz systému, ale výsledky se mohou lišit. Nezapínejte ani nepoužívejte Flex v podmínkách mimo tyto hranice. Podmínky skladování a přepravy platí pouze v případě, že je robot zcela odpojen od napájení a jiných zařízení.
2.2 Rozbalení
Gratulujeme! Váš Opentrons Flex dorazil a vy jste pro něj připravili prostor ve vaší laboratoři. Otevřeme tu bednu s příšerami, vyjmeme robota a připravíme ho k provozu. Informace v této části poskytují seznam dílů a pokyny, které vás provedou kroky potřebnými k vybalení, nastavení a připravenosti Flexu k použití. Postup nastavení jsme rozdělili do tří částí:
Část 1 se týká demontáže přepravky. Část 2 se týká vyjmutí Flex z přepravky a jeho přesunutí na místo konečné montáže. Část 3 se poprvé zabývá konečnou montáží a zapnutím robota.
Vyžaduje úsilí a čas
Budete chtít požádat partnera v laboratoři, aby vám pomohl s procesem vybalování, zvedání, přesunu a montáže. Na toto úsilí si budete muset vyčlenit přibližně 30 minut až hodinu.
Poznámka: Ke správnému zvedání Flex vyžaduje dvě osoby. Také zvedání a přenášení Flex za rukojeti je nejlepší způsob, jak robota přemisťovat.
Přepravka a balicí materiál
Rozbalením Flex získáte úžasného robota, ale také vám zbyde několik velkých panelů přepravek spolu s různými přepravními komponenty a vycpávkami. I když můžete tento materiál zlikvidovat, doporučujeme vám, abyste si tyto položky ponechali, pokud je k dispozici úložný prostor. Obal je opakovaně použitelný, což pomáhá připravit váš Flex na odeslání, pokud jej budete někdy v budoucnu potřebovat poslat někam jinam (např. na konferenci nebo do nového zařízení).

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
Prvky produktu
Flex se dodává s níže uvedenými součástmi. Pipety, chapadlo a moduly se dodávají v samostatném balení z hlavní přepravky Flex, i když jste je zakoupili společně jako pracovní stanici.

(1) Robot Opentrons Flex

(1) Kabel USB

(1) Napájecí kabel

(1) Ethernetový kabel

(5) L-klíče (12 mm šestihran, 1.5 mm šestihran, 2.5 mm šestihran, 3 mm šestihran,
T10 Torx)

(1) Přívěsek nouzového zastavení

(1) Slot na palubní desku se svorkami pro laboratorní vybavení

(4) Náhradní svorky na laboratorní vybavení

(1) Pipetujte kalibrační sondu

(4) Rukojeti a čepice

(1) Horní okenní panel

(4) Panely bočních oken

(1) 2.5 mm šestihranný šroubovák

(1) 19 mm klíč

(16 + náhradní díly) Okenní šrouby (M4x8 mm s plochou hlavou)
26

(10) Šrouby do drážky pro náhradní palubu (M4x10 mm nástrčná hlava)

(12) Náhradní upevňovací šrouby palubní desky (M3x6 mm vnitřní hlava)

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
Část 1: Odstraňte přepravku
Opentrons dodává váš Flex v robustní překližkové bedně. Přepravní bedna používá hák a západku třamps k zajištění horního, bočního a spodního panelu k sobě. Použití západek místo hřebíků nebo šroubů znamená, že k rozebrání přepravky nebudete potřebovat páčidlo (nebo velkou sílu) a v případě potřeby ji můžete později znovu sestavit.
Poznámka: Okraje přepravky se mohou během přepravy zdrsnit. Možná budete chtít použít pracovní rukavice k ochraně rukou před dřevěnými třískami.
Chcete-li západky uvolnit, vyklopte západku nahoru a otočte ji doleva (proti směru hodinových ručiček). Tato akce přesune třamp rameno z jeho odpovídající přídržné konzoly. Poté můžete odklopit rameno západky z přepravky.
1 Odemkněte osm západek, které drží horní část po stranách.

2 Po uvolnění západek sejměte horní panel.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ 3 Rozřízněte modrý přepravní sáček, odstraňte tyto položky z vycpávky a odložte je:
Uživatelská sada Napájecí, ethernetové a USB kabely Přívěsek nouzového zastavení
4 Odstraňte horní část pěnové výplně, abyste odkryli okenní panely. Polstrování chrání boční a horní panely.
5 Odstraňte okenní panely a odložte je stranou. Ty připojíte později.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
6 Odemkněte zbývajících 16 západek, které drží boční panely k sobě a ke spodní části přepravky. 7 Odstraňte boční panely a odložte je stranou.
Část 2: Uvolněte Flex
Po dokončení kroků v části 1 byste nyní měli vidět robota, který je v ochranném sáčku a připevněný k oranžovým ocelovým montážním součástem. Taška obepíná robota a chrání ho před vnějším prostředím. Ocelové držáky zajišťují robota ke dnu přepravky. Dva přepravní rámy podporují robota, rovnoměrně rozkládají jeho váhu a udržují jej pevný, aby se během přepravy nezkroutil. Pokračujte v rozbalování Flex a sejměte jej ze základny přepravky.
8 Pomocí 19mm klíče z uživatelské sady odšroubujte držáky ze dna přepravky. Závorky můžete zlikvidovat nebo si je uložit pro budoucí použití.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ 9 Zatáhněte nebo srolujte přepravní vak úplně dolů, abyste odhalili celého robota.
10 S pomocí svého laboratorního partnera uchopte držadla v oranžových přepravních rámech na obou stranách základny robota, zvedněte Flex ze základny přepravky a položte jej na podlahu. Uložte nebo zlikvidujte základnu bedny a přepravní rám.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ 11 Pomocí 12mm šestihranného L-klíče z uživatelské sady odstraňte čtyři šrouby, které drží přepravní rámy.
Flex. Uložte nebo zlikvidujte rámy a šrouby.
12 Vyjměte čtyři hliníkové rukojeti z uživatelské sady. Našroubujte rukojeti na stejná místa, která držela 12mm šrouby přepravního rámu.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
13 S pomocí vašeho laboratorního partnera zvedněte Flex za jeho rukojeti a přesuňte jej na pracovní stůl ke konečné montáži.

Část 3: Konečná montáž a zapnutí
Po přestěhování Flex do dočasného pracovního prostoru nebo jeho trvalého domova je čas dokončit úpravy vašeho nového robota.
14 Pokud jste robot přemístili na jeho konečné pracovní místo, sejměte držadla pro přenášení a nahraďte je koncovými uzávěry. Krytky uzavírají otvory pro rukojeti v rámu a dodávají robotu čistý vzhled. Vraťte rukojeti do uživatelské sady k uložení.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
15 Vyjměte horní a boční panely z balicí pěny, kterou jste odložili, po odstranění vršku přepravky.
16 Nasaďte okenní panely na Flex podle informací na štítku na přední ochranné fólii. Poté odstraňte ochrannou fólii.
17 Pomocí zkosených okenních šroubů a 2.5 mm šroubováku z uživatelské sady připevněte okenní panely k Flex. Ujistěte se, že zkosené otvory (ve tvaru V) v okenních panelech směřují ven (směrem k vám). To umožňuje, aby šrouby lícovaly s povrchem okna.

Varování: Nesprávná orientace panelů může vést k poškození. Nadměrný utahovací moment šroubu může panely prasknout. Rukou utáhněte šrouby, dokud nebudou okenní panely přiměřeně zajištěny. Toto není zkouška síly.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ 18 Pomocí 2.5 mm šroubováku z uživatelské sady odstraňte zajišťovací šrouby z portálu. Tyto
šrouby zabraňují pohybu portálu během přepravy. Pojistné šrouby portálu jsou umístěny: Na levé boční kolejnici poblíž přední části robota. Pod vertikálním portálovým ramenem. Na pravé boční liště poblíž přední části robota v oranžovém držáku. Jsou zde dva šrouby.
Po odstranění všech přepravních šroubů se portál snadno pohybuje rukou. 19 Odřízněte a odstraňte dva gumové pásy, které drží odpadkový koš na místě během přepravy.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
20 Připojte napájecí kabel k Flex a zapojte jej do elektrické zásuvky. Ujistěte se, že plocha paluby je bez překážek. Přepněte vypínač na levé zadní straně robota. Po zapnutí se portál přesune do svého domovského umístění a na dotykové obrazovce se zobrazí další konfigurační pokyny.

Nyní, když je váš Flex vybalený a připravený k použití, pokračujte do sekce První spuštění níže.
2.3 První spuštění
Před připojením jakéhokoli dalšího hardwaru k vašemu Flex proveďte základní nastavení na dotykové obrazovce. Robot vás provede připojením k vaší laboratorní síti, aktualizací na nejnovější software a personalizací Flex tím, že mu dá jméno.
Zapněte napájení
Po zapnutí Flex se na dotykové obrazovce objeví logo Opentrons. Po chvíli se zobrazí obrazovka „Welcome to your Opentrons Flex“.
Uvítací obrazovka Opentrons Flex. Tuto obrazovku byste měli vidět pouze při prvním spuštění Flex.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
Připojte se k síti nebo počítači
Postupujte podle pokynů na dotykové obrazovce a připojte svého robota, aby mohl zkontrolovat aktualizace softwaru a přijmout protokol files. Existují tři způsoby připojení: Wi-Fi, Ethernet a USB.

Možnosti připojení k síti. K nastavení Flex potřebujete připojení k internetu. Wi-Fi: Pomocí dotykové obrazovky se připojte k sítím Wi-Fi, které jsou zabezpečeny osobním ověřováním WPA2 (do této kategorie spadá většina sítí, které pro připojení vyžadují pouze heslo).
Poznámka: Flex nepodporuje captive portály (sítě, které nemají heslo, ale načítají a webstránka pro ověření uživatelů po připojení).
Můžete se také připojit k otevřené síti Wi-Fi, ale to se nedoporučuje.
Upozornění: Připojení k otevřené síti Wi-Fi umožní komukoli v dosahu síťového signálu ovládat vašeho robota Opentrons Flex bez ověřování.

Pokud se potřebujete připojit k síti Wi-Fi, která používá podnikové ověřování (včetně „eduroam“ a podobných akademických sítí, které vyžadují uživatelské jméno a heslo), nejprve se připojte k aplikaci Opentrons přes Ethernet nebo USB a dokončete počáteční nastavení. Poté se připojte k podnikové síti Wi-Fi v nastavení sítě pro váš Flex. Přístup k nastavení sítě:

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
1. Klikněte na Devices v levém postranním panelu aplikace Opentrons. 2. Klikněte na nabídku se třemi tečkami () pro váš Flex a vyberte Nastavení robota. 3. Klepněte na kartu Networking.
Vyberte svou síť z rozbalovací nabídky nebo zvolte „Připojit se k jiné síti…“ a zadejte její SSID. Vyberte metodu podnikového ověřování, kterou vaše síť používá. Podporované metody jsou:
EAP-TTLS s TLS EAP-TTLS s MS-CHAP v2 EAP-TTLS s MD5 EAP-PEAP s MS-CHAP v2 EAP-TLS
Každá z těchto metod vyžaduje uživatelské jméno a heslo a v závislosti na přesné konfiguraci sítě může vyžadovat certifikát files nebo jiné možnosti. Podrobnosti o nastavení sítě získáte v dokumentaci IT vašeho zařízení nebo se obraťte na svého IT manažera.
Ethernet: Připojte svého robota k síťovému přepínači nebo rozbočovači pomocí ethernetového kabelu. Můžete se také připojit přímo k ethernetovému portu na vašem počítači, počínaje verzí robotického systému 7.1.0.
USB: Připojte dodaný kabel USB A-to-B k portu USB-B robota a otevřenému portu na vašem počítači. Pokud váš počítač nemá port USB-A, použijte kabel USB B-to-C nebo adaptér USB A-C-C.
Chcete-li pokračovat v nastavení, musí mít připojený počítač nainstalovanou a spuštěnou aplikaci Opentrons. Podrobnosti o instalaci aplikace Opentrons najdete v části Instalace aplikace v kapitole Software a provoz.
Nainstalujte aktualizace softwaru
Nyní, když jste se připojili k síti nebo počítači, může robot zkontrolovat aktualizace softwaru a firmwaru a v případě potřeby je stáhnout. Pokud existuje aktualizace, může instalace trvat několik minut. Po dokončení aktualizace se robot restartuje.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
Připojte přívěsek nouzového zastavení
Připojte přiložený přívěsek nouzového zastavení (E-stop) k pomocnému portu (AUX-1 nebo AUX-2) na zadní straně robota.

Před a po připojení přívěsku nouzového zastavení.
Připojení a povolení nouzového zastavení je povinné pro připojení přístrojů a spuštění protokolů na Flex. Další informace o používání nouzového zastavení během provozu robota naleznete v části Přívěsek nouzového zastavení v kapitole Popis systému.
Dejte svému robotovi jméno
Pojmenování robota vám umožní snadno jej identifikovat ve vašem laboratorním prostředí. Pokud máte ve své síti více robotů Opentrons, nezapomeňte jim dát jedinečná jména. Jakmile potvrdíte jméno svého robota, budete přesměrováni na svůj Opentrons Flex Dashboard. Pravděpodobně dalším krokem, který budete chtít udělat, je připevnění nástrojů, které je popsáno v další části.
2.4 Instalace a kalibrace přístroje
Po počátečním nastavení robota je dalším krokem připojení nástrojů k robotu a jejich kalibrace.
Chcete-li nainstalovat nástroj, nejprve klepněte na Instruments na dotykové obrazovce nebo přejděte do sekce Pipety a moduly na obrazovce podrobností zařízení v aplikaci Opentrons. Vyberte prázdný držák a vyberte buď Připojit pipetu nebo Připojit uchopovač. Pokud je držák, který chcete použít, již obsazený, musíte nejprve odpojit pipetu nebo chapadlo.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
Poznámka: Celkový proces instalace je stejný bez ohledu na to, zda používáte dotykovou obrazovku nebo aplikaci Opentrons. Bez ohledu na to, na jakém zařízení začnete, bude proces instalace řídit, dokud jej nedokončíte nebo nezrušíte.
Pokud začnete na dotykové obrazovce, aplikace zobrazí robota jako „zaneprázdněného“. Pokud začnete v aplikaci, na dotykové obrazovce se zobrazí modální označení, že probíhá instalace přístroje.
Přesný proces instalace se liší v závislosti na nástroji, který připojujete, jak je popsáno v částech níže. Všechny přístroje mají automatický postup kalibrace, který byste měli provést ihned po instalaci.
Instalace pipety
Když nainstalujete pipetu, budete na dotykové obrazovce nebo v aplikaci Opentrons provedeni následujícími kroky.
1. VYBERTE TYP PIPETY Vyberte si mezi 1- nebo 8-kanálovou pipetou a 96-kanálovou pipetou. Připojení 96-kanálové pipety vyžaduje několik dalších kroků, protože se připevňuje ke speciální montážní desce, která překlenuje oba držáky pipety.
2. PŘIPRAVTE SE NA INSTALACI Vyjměte laboratorní náčiní z plošiny a vyčistěte pracovní plochu, abyste si usnadnili připojení a kalibraci. Připravte si také potřebné vybavení, jako je kalibrační sonda, šestihranný šroubovák a montážní deska (pro 96kanálovou pipetu).
3. PŘIPOJTE A ZAJIŠTĚTE PIPETU Portál se přesune do přední části robota, abyste mohli připevnit pipetu.
1- a 8-kanálové pipety se připojují přímo k držáku pipety. 96kanálová pipeta vyžaduje montážní desku. Abyste mohli připevnit montážní desku, musíte nejprve odpojit vozík osy z pro správný držák pipety.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
Připojte pipetu ke zvolenému držáku pipety a zajistěte její šrouby.
4. SPUŠTĚNÍ AUTOMATIZOVANÉ KALIBRACE Pro kalibraci pipety připojte kalibrační sondu k příslušné pipetové trysce. Pipeta se automaticky posune tak, aby se dotkla určitých bodů na desce, a uloží tyto kalibrační hodnoty pro budoucí použití. Po dokončení kalibrace a vyjmutí sondy bude pipeta připravena k použití v protokolech.
Instalace chapadla
Když nainstalujete chapadlo, budete na dotykové obrazovce nebo v aplikaci Opentrons provedeni následujícími kroky.
1. PŘIPRAVTE SE NA INSTALACI Vyjměte laboratorní náčiní z plošiny a vyčistěte pracovní plochu, abyste si usnadnili připojení a kalibraci. Připravte si také potřebný šestihranný šroubovák a ujistěte se, že je kalibrační kolík ve své úložné oblasti na chapači.
2. PŘIPOJTE A ZAJIŠTĚTE CHAPAČ Portál se přesune do přední části robota, abyste mohli připojit chapadlo. Připojte chapadlo k prodlužovacímu držáku a zajistěte jeho šrouby.
3. SPUŠTĚNÍ AUTOMATIZOVANÉ KALIBRACE Pro kalibraci chapadla vložte kalibrační kolík do přední čelisti. Chapadlo se automaticky přesune tak, aby se dotklo určitých bodů na desce a uložilo tyto kalibrační hodnoty pro budoucí použití. Poté opakujte stejný postup s kalibračním kolíkem v zadní čelisti. Jakmile je kalibrace dokončena a kolík vrátíte na místo uložení, bude chapadlo připraveno k použití v protokolech.
2.5 Přemístění
Tato část poskytuje rady a pokyny, jak přemístit robota Opentrons Flex na krátké a dlouhé vzdálenosti.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
Krátké pohyby
Krátký pohyb zahrnuje řadu vzdáleností od „přesuňte to trochu“ až po laboratoř, chodbu nebo jiné patro vaší budovy. V těchto případech můžete Flex pohybovat ručně. Dobrou variantou je i přeprava na ručním vozíku.
Upozornění: Flex váží 88.5 kg. V důsledku toho jej bezpečně zvednou a přemístí dva lidé.
Znovu připojte zvedací rukojeti a přemístěte Flex na nové, blízké místo. Zvedání a přenášení Flex za rukojeti je tím správným způsobem, jak přesunout robota na krátké vzdálenosti. Po dokončení přesunu sejměte rukojeti a uložte je do uživatelské sady. Abyste zabránili poškození robota, vždy jej zvedněte a přemístěte pomocí zvedacích rukojetí. Při zvedání nebo přemisťování robota nechytejte rám.
Pohyby na dlouhé vzdálenosti
Přesun na dlouhou vzdálenost přenese váš Flex z areálu vaší univerzity, zařízení nebo instituce. Přes město, do nového města, státu, provincie nebo země jsou všechny examppohyb na dlouhou vzdálenost. V takovém případě budete muset Flex zabalit, abyste jej ochránili před živly, otřesy a hrubými pohyby, které mohou nastat během přepravy.
Pokud jste si ponechali přepravní bednu a vnitřní podpěry, které byly dodány s vaším Flexem, můžete jej znovu zabalit do těchto materiálů a přepravit se na dlouhé vzdálenosti. Postupujte podle kroků vybalení v opačném pořadí a připravte svůj Flex na přesun na dlouhou vzdálenost. V zásadě byste měli:
Odpojte napájecí a síťový kabel, pokud je připojen. Odstraňte veškerý připojený hardware a laboratorní software. Znovu připevněte palubní desky. Zamkněte portál (viz část Obecné pokyny pro přesun níže). Odstraňte a uložte okenní panely.
Pokud jste si ponechali původní bednu:
Znovu připojte přepravní rám k Flex a zajistěte jej k základně palety pomocí L-držáků. Přidejte vycpávku a znovu sestavte přepravní bednu.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
Pokud nemáte původní přepravku a související materiál, kontaktujte renomovanou přepravní společnost. Mohou za vás řídit proces balení, přepravy a doručení.
Obecné rady ohledně stěhování
ODPOJTE NAPÁJENÍ A SÍŤOVÉ KABELY Před přemístěním vašeho Flex nezapomeňte: Vypněte napájení a odpojte jej od zdroje napájení. Odpojte ethernetový nebo USB kabel, pokud je použit.
ZAMKNOUT GANTRY Před přemístěním Flex znovu zasuňte zajišťovací šrouby, aby držel portál na místě. Uzamykací body portálu jsou umístěny: Na levé boční kolejnici poblíž přední části robota. Pod vertikálním portálovým ramenem. Na pravé boční zábradlí poblíž přední části robota. Uzamčení této části portálu vyžaduje malý
oranžový držák a dva zajišťovací šrouby.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
DOMA GANTRY Možná nebudete chtít zamykat portál, pokud robota pouze přesouváte na blízké místo. Pokud se rozhodnete jej nezamknout, použijte alespoň dotykovou obrazovku nebo aplikaci Opentrons k odeslání portálu do výchozí polohy, než jej vypnete. Chcete-li portál vrátit pomocí dotykové obrazovky, klepněte na nabídku se třemi tečkami () a potom klepněte na položku Domovská brána. Chcete-li vrátit portál přes aplikaci Opentrons: Klikněte na Zařízení. Klikněte na svůj Flex v seznamu zařízení. Klikněte na nabídku se třemi tečkami () a poté na Domovská brána.
ODSTRAŇTE MODULY Palubní moduly a další příslušenství zvyšují váhu vašeho Flex. Ovlivňují také těžiště robota, což může způsobit, že se při zvedání bude cítit „nakloněný“. Abyste robota odlehčili a vyvážili, odstraňte všechny připojené nástroje a laboratorní vybavení, než ho zvednete.
ZNOVU NAINSTALUJTE DRÁHY PODLAHY Pro přesun na dlouhé vzdálenosti doporučujeme znovu nasadit sloty na palubě. Zajištění slotů na jejich původních místech pomáhá předcházet náhodné ztrátě. Opětovné připevnění štěrbin na palubě pro krátké pohyby po laboratoři je volitelné.
REALIBRACE POST-MOVE Po opětovné instalaci byste měli překalibrovat všechny přístroje a moduly. Další podrobnosti o kalibraci modulu naleznete v kapitole Moduly.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 2: INSTALACE A PŘEMÍSTĚNÍ
Poslední úvahy o stěhování
Váš Flex je robustní a dobře stavěný stroj, ale je to také přesný vědecký přístroj navržený pro přesné tolerance. V důsledku toho byste s ním měli zacházet opatrně, když jej přemisťujete v rámci místní pracovní oblasti nebo jej posíláte po celé zemi. To znamená řídit se zde uvedenými pokyny a používat svůj vlastní zdravý rozum, jak přepravovat drahý kus laboratorního vybavení. Sečteno a podtrženo: při přemisťování Flex buďte opatrní a extra polstrování.
Pokud máte dotazy nebo obavy ohledně přemístění vašeho Flex, kontaktujte nás na adrese support@opentrons.com.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3
Popis systému

Tato kapitola popisuje hardwarové systémy Opentrons Flex, které jsou základem jeho hlavních funkcí automatizace laboratoře. Palubní, portálové a přístrojové držáky Opentrons Flex umožňují použití přesných komponentů pro manipulaci s kapalinami a laboratorními předměty. Dotyková obrazovka na zařízení umožňuje spouštění protokolů a kontrolu stavu robota, aniž byste museli přenášet počítač do laboratoře. Kabelová i bezdrátová konektivita umožňuje další ovládání z aplikace Opentrons (podrobnosti viz kapitola Software a provoz) a rozšíření funkcí systému připojením periferií (viz kapitola Moduly).

3.1 Fyzické komponenty

Fotoaparát

Stavové světlo

Dotyková obrazovka

Rám

Portálová paluba
Přední dveře
Umístění fyzických součástí Opentrons Flex.

Krytky bočních oken

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

Rám a kryt
Rám robota Opentrons Flex poskytuje tuhost a konstrukční podporu pro jeho palubu a portál. Všechny mechanické subsystémy jsou umístěny a namontovány na hlavním rámu. Rám je konstruován především z plechu a hliníkových výlisků.
Kovový rám má otvory pro boční okna a přední dveře z průhledného polykarbonátu, které vám umožní vidět, co se děje uvnitř Flex. Panty předních dveří se otevírají pro přístup do vnitřku systému. S otevřenými předními dvířky můžete připojit nástroje, moduly a příslušenství paluby; připravit balíček před protokolem; nebo manipulovat se stavem balíčku během protokolu.
Bílé LED pásky na vnitřních horních hranách rámu poskytují softwarově ovladatelné okolní osvětlení. 2megapixelová kamera může fotografovat palubu a pracovní plochu pro záznam a sledování provádění protokolu.

Paluba a pracovní plocha
Deska je obrobený hliníkový povrch, na kterém jsou prováděny automatizované vědecké protokoly. Balíček má 12 hlavních slotů ve formátu ANSI/SLAS, které lze překonfigurovat tak, aby obsahovaly laboratorní software, moduly a spotřební materiál. Sloty paluby jsou identifikovány souřadnicovým systémem, přičemž slot A1 je vlevo vzadu a slot D3 vpravo vpředu.

Pracovní plocha rozšiřujícího slotu (pro termocykler).

Stagoblast

Oblasti paluby v rámci Flex.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU
Pracovní prostor je fyzický prostor nad palubou, který je přístupný pro pipetování. Labware umístěné ve slotech A1 až D3 jsou v pracovní oblasti.
Opentrons Flex je dodáván s odnímatelnými sloty pro všech 12 pozic v pracovní oblasti. Každý slot na palubě má rohové svorky na laboratorní nádobí pro bezpečné umístění laboratorního nádobí na palubu.
Balíček můžete překonfigurovat výměnou slotů za jiné příslušenství paluby, včetně pohyblivého koše, odpadního skluzu a nosičů modulů. Rozšiřující slot za A1 se používá pouze k vytvoření dalšího místa pro modul Thermocycler, který zabírá sloty A1 a B1.
Poznámka: Sloty decků jsou zaměnitelné v rámci sloupce (1, 2 nebo 3), ale ne napříč sloupci; sloty pro sloupec 1 a sloupec 3 jsou odlišné kusy navzdory jejich podobné velikosti. Do kterého sloupce se slot dostane, poznáte podle orientace modré svorky laboratorního vybavení vlevo vzadu.
Měli byste ponechat sloty na palubě nainstalované v místech, kam chcete umístit samostatný laboratorní software. Deska a předměty na ní umístěné zůstávají statické, pokud se nepohybují chapadlem nebo ručním zásahem.
Stagoblast
Staging area je další prostor podél pravé strany paluby. Na tomto místě můžete uložit laboratorní software po instalaci stagsloty oblasti. Labware umístěné ve slotech A4 až D4 jsou v stagoblast. Flex pipety nemohou dosáhnout do stagv oblasti, ale chapadlo může vyzvednout a přesunout laboratorní vybavení do az tohoto místa. Přidání dalších slotů pomáhá udržovat pracovní oblast dostupnou pro zařízení používaná ve vašich automatických protokolech.
StagSloty pro oblast jsou součástí určitých konfigurací pracovních stanic a lze je také zakoupit na adrese https://shop.opentrons.com.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

Staging Oblast s nainstalovanými sloty

Zařízení paluby
Svítidla jsou hardwarové položky, které nahrazují standardní sloty. Umožňují vám přizpůsobit rozvržení paluby a přidat funkčnost do vašeho Flex. V současné době patří mezi vybavení paluby stagštěrbiny v oblasti, vnitřní odpadkový koš a vnější odpadní skluz. Zařízení můžete nainstalovat pouze do několika konkrétních slotů na palubě. Následující tabulka uvádí umístění decků pro každé zařízení.

Svítidlo Stagštěrbiny v prostoru Odpadkový koš Skluz na odpad Skluz na odpad s stagslot pro oblast

Sloty A3D3 A1D1 a A3-D3 D3 pouze D3

Svítidla jsou bez napájení. Neobsahují elektronické ani mechanické součásti, které robotovi sdělují svůj aktuální stav a polohu paluby. To znamená, že musíte použít funkci konfigurace decku, abyste dali Flex vědět, jaká zařízení jsou připojena k decku a kde jsou umístěna.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

K nastavení konfigurace paluby můžete přistupovat z dotykové obrazovky prostřednictvím nabídky se třemi tečkami () a z aplikace Opentrons. Informace o konfiguraci decku z dotykové obrazovky najdete v části Konfigurace decku v kapitole Software a provoz.

Odpadní skluz
Odpadní žlab Opentrons Flex přenáší tekutiny, špičky, stojany na špičky a destičky s jamkami z pouzdra Flex do nádoby na odpadky umístěné pod jeho vnějším otvorem. Odpadní skluz se připojuje k adaptéru palubní desky, který zapadá do slotu D3. Dodává se také se speciálním polovičním panelem okna, který umožňuje vysouvání skluzu ven z přední části robota.
Součásti odpadového skluzu.

Adaptér krycí desky

Odpadní skluz
Adaptér palubní desky s Stagoblast

Stagsloty oblasti
StagSloty v oblasti jsou ANSI/SLAS kompatibilní díly paluby, které nahrazují standardní sloty ve sloupci 3 a přidávají nové sloty do staging area — to vše bez ztráty místa v pracovní oblasti. Můžete nainstalovat jeden slot nebo maximálně čtyři sloty a vytvořit nový sloupec (A4 až D4) podél pravé strany balíčku. Pamatujte však, že výměna štěrbiny A3 vyžaduje přesunutí odpadkového koše. Přidáním stagDíky prostorovým slotům na palubě může váš robot Flex uložit více laboratorního vybavení a pracovat efektivněji.

OPENTRONS FLEX

Společnost Flex stagslot pro oblast.
49

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU
INSTALACE SLOTU
Chcete-li nainstalovat, odstraňte šrouby, které připevňují standardní slot k desce, a nahraďte jej stagslot pro oblast. Po instalaci pomocí dotykové obrazovky nebo aplikace Opentrons sdělte robotovi, kterého jste přidalitaging area slot na palubu.
Instalace jakotagslot pro oblast.

KOMPATIBILITA SLOTŮ StagSloty pro oblast jsou kompatibilní s níže uvedenými nástroji, moduly a laboratorním softwarem Flex.

Moduly pro uchopovací pipety Flex komponent
Labware

Stagkompatibilita oblasti
Flex Gripper může přesouvat labware do nebo ze stagsloty oblasti.
Flex pipety nemohou dosáhnout stagoblast. Pomocí chapadla přesuňte stojany na špičky a laboratorní náčiní ze stagpřed pipetováním do pracovní oblasti.
Magnetický blok GEN1 lze umístit do sloupce 3 nad astagslot pro oblast. Moduly nejsou ve sloupci 4 podporovány.
Napájené moduly jako Heater-Shaker a Temperature Module se vejdou do nosičů, které lze umístit do sloupce 3. Nemůžete přidat jakotaging area slot do pozice obsazené modulovým nosičem.
Stagštěrbiny mají stejné rozměry ANSI/SLAS jako standardní štěrbiny. Používejte laboratorní vybavení kompatibilní s chapadly v stagnebo ručně přidat a odebrat laboratorní software z tohoto umístění.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU
Pohybový systém
K rámu je připevněn portál, který je systémem pohybu a polohování robota. Portál se pohybuje odděleně podél osy x a y, aby umístil pipety a chapadlo na přesná místa pro provádění protokolu. Pohyb podél těchto os je přesný s přesností na 0.1 mm. Portál je řízen hybridními bipolárními krokovými motory 36 VDC. Na druhé straně jsou k portálu připojeny držáky na pipety a prodlužovací držák. Ty se pohybují podél osy z, aby umístily pipety a chapadlo na přesná místa pro provádění protokolu. Pohyb podél této osy je řízen hybridními bipolárními krokovými motory 36 VDC. Elektronika obsažená v gantry poskytuje 36 V DC napájení a komunikaci s pipetami a chapadlem, když jsou připojeny.
Portál

Držáky na pipety

Prodlužovací držák

Umístění držáků přístroje na Flex.

Dotykový displej a LED displeje
Primárním uživatelským rozhraním je 7palcový dotykový LCD displej umístěný na pravé přední straně robota. Dotykový displej je pokryt Gorilla Glass 3 pro odolnost proti poškrábání a poškození. Získejte přístup k mnoha funkcím Flex přímo na dotykové obrazovce, včetně:

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

Správa protokolů Nastavení, provádění a monitorování protokolu Správa Labware Nastavení robota Aktualizace systémového softwaru a firmwaru Provozní protokoly a upozornění na chyby
Další informace o používání Flex prostřednictvím dotykové obrazovky naleznete v části Ovládání dotykové obrazovky v kapitole Software a obsluha.
Stavové světlo je pás LED podél horní přední části robota, který poskytuje rychlé informace o robotovi. Různé barvy a vzory osvětlení mohou komunikovat různé úspěchy, neúspěchy nebo stavy nečinnosti:

Barva LED Bílá Neutrální stavy
Zelená Normální stavy
Modrá Povinné stavy Žlutá Abnormální stavy Červená Nouzové stavy

Vzor LED Svítí pulzující
Bliká dvakrát
Pevné pulzující pulzování

Stav robota
Zapnutý a neběží protokol Robot je zaneprázdněn (např. aktualizace softwaru nebo firmwaru, nastavení běhu protokolu, zrušení běhu protokolu) Akce je dokončena (např. protokol uložen, software aktualizován, přístroj připojen nebo odpojen) Protokol je spuštěn Protokol je dokončen Protokol je pozastaven

Solidní

Softwarová chyba

Bliká třikrát, opakovaně

Fyzická chyba (např. selhání přístroje)

Stavovou kontrolku lze také deaktivovat v nastavení robota.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU
3.2 Pipety
Pipety Opentrons jsou konfigurovatelná zařízení používaná k pohybu kapalin v pracovní oblasti během provádění protokolů. Existuje několik pipet Opentrons Flex, které zvládnou objemy od 1 µL do 1000 µL v 1, 8 nebo 96 kanálech:
Opentrons Flex 1-kanálová pipeta (1 µL) Opentrons Flex 50-Channel Pipeta (1 µL) Opentrons Flex 5-kanálová pipeta (1000 µL) Opentrons Flex 8-kanálová pipeta (1 µL) Opentrons Flex 50 µL Pipeta 8-Chan
Pipety se připevní k portálu pomocí šroubů na přední straně pipety. 1-kanálové a 8-kanálové pipety každá zabírají jeden držák pro pipetu (levý nebo pravý); 96kanálová pipeta zabírá oba držáky. Podrobnosti o instalaci pipet naleznete v části Instalace a kalibrace přístroje.

Zajatá příloha
Šrouby

Upevňovací šrouby

Vyhazovač

Trysky (vyměnitelné O-kroužky)

Trysky (pevné O-kroužky)

Umístění součástí 1-, 8- a 96kanálových pipet.

Vyhazovač

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

Pipety nabírají jednorázové plastové špičky jejich přitlačením na pipetové trysky a poté špičky používají k nasávání a dávkování kapalin. Celková síla potřebná pro uchopení se zvyšuje, když se současně zvedne více hrotů. U menšího počtu špiček pipeta připojí špičky zatlačením každé pipetové trysky dolů do špičky. K dosažení potřebné síly k nabrání plného stojanu špiček, 96kanálová pipeta také vytáhne špičky nahoru na trysky. Toto vytažení vyžaduje umístění stojanů na špičky do adaptéru stojanu na špičky, nikoli přímo do štěrbiny na palubě. Chcete-li špičky vyhodit (nebo je vrátit do stojanu), mechanismus vyhazovače pipet odtlačí špičky z trysek.

Specifikace pipety
Pipety Opentrons Flex jsou navrženy tak, aby zvládly široký rozsah objemů. Vzhledem k jejich širokému celkovému rozsahu mohou používat různé velikosti hrotů, které ovlivňují jejich vlastnosti při manipulaci s kapalinou. Společnost Opentrons testovala pipety Flex na přesnost a preciznost v řadě kombinací špiček a objemů kapaliny:

Pipeta
Flex 1-kanál
50 ul
Flex 1-kanál
1000 ul
Flex 8-kanál
50 ul
Flex 8-kanál
1000 ul

Kapacita hrotu 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

Testovaný objem 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 ul 1000 ul
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

Přesnost %D 8.00 % 1.50 % 1.25 % 5.00 % 0.50 % 0.50 % 0.50 % 10.00 % 2.50 % 1.25 % 8.00 % 2.50 % 1.00 % 0.70 %

Přesnost %CV 7.00 % 0.50 % 0.40 % 2.50 % 0.30 % 0.15 % 0.15 % 8.00 % 1.00 % 0.60 % 4.00 % 0.60 % 0.25 % 0.15 %

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

Flex 96-kanál
1000 ul

50 ul 50 ul 200 ul 1000 ul

5 ul 50 ul 200 ul 1000 ul

10.00% 2.50% 1.50% 1.50%

5.00% 1.25% 1.25% 1.50%

Při výběru špiček pro vaši pipetu mějte na paměti tyto informace o přesnosti. Obecně platí, že pro dosažení nejlepších výsledků byste měli používat nejmenší hroty, které splňují potřeby vašeho protokolu.

Poznámka: Opentrons provádí objemové testování pipet Flex, aby se ujistil, že splňují výše uvedené specifikace přesnosti a přesnosti. Před použitím nemusíte kalibrovat objem, který vaše pipety dávkují. Musíte provést pouze polohovou kalibraci. Podrobnosti naleznete v další části a také v části Instalace pipety v kapitole Instalace a přemístění.
Služby Opentrons Care a Opentrons Care Plus zahrnují každoroční výměnu pipet a certifikáty o kalibraci. Podrobnosti naleznete v části Servis Flex v kapitole Údržba a servis.

Kalibrace pipety
Uživatelská sada obsahuje kovovou pipetovou kalibrační sondu, kterou používáte při polohové kalibraci. Během běhu protokolu bezpečně uložte sondu na magnetický držák na předním sloupku robota. Během procesu kalibrace připojte sondu k příslušné trysce a zajistěte ji na místě. Robot přesune sondu do kalibračních bodů na palubě, aby změřil přesnou polohu pipety.
Adaptér stojanu na špičky pipet
96kanálová pipeta Opentrons Flex se dodává se čtyřmi adaptéry stojanu na špičky. Jedná se o přesně tvarované hliníkové držáky, které umístíte na palubu. Adaptéry drží stojany na špičky Flex 50 L, 200 L a 1000 µL.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU
Kvůli vynaložené síle vyžaduje 96kanálová pipeta adaptér pro správné připojení plného stojanu na špičky. Během připevňovacího postupu se pipeta přesune přes adaptér, spustí se na montážní kolíky a natáhne špičky na pipety zvednutím adaptéru a stojanu na špičky. Tahání špiček místo tlačení poskytuje pákový efekt potřebný k zajištění špiček k pipetám a zabraňuje deformaci povrchu desky. Po dokončení 96kanálová pipeta spustí adaptér a prázdný stojan na špičky na palubu. Další informace naleznete v části Tipy a stojany na špičky v kapitole Labware.
Částečné vyzvednutí hrotu
96kanálová pipeta dokáže nabrat plný stojan na špičky nebo menší počet špiček. To zvyšuje počet aplikací, které můžete provádět s 96kanálovou pipetou, protože zabírá oba držáky pipety.
V současné době 96kanálová pipeta podporuje částečné nabírání špiček pro 8 špiček v uspořádání sloupců. V této konfiguraci pipeta používá buď své trysky nejvíce vlevo k nabírání špiček ze stojanu na špičky zprava doleva, nebo své trysky zcela vpravo k nabírání špiček ze stojanu na špičky zleva doprava.
Při sbírání méně než 96 špiček ze stojanu na špičky musí být stojan umístěn přímo na desku, nikoli v adaptéru stojanu na špičky.
Pipetové senzory
Pipety Opentrons Flex mají řadu senzorů, které detekují a zaznamenávají údaje o stavu pipety a případných špičkách, které zvedla.
KAPACITNÍ SNÍMAČE
V kombinaci s kovovou sondou nebo vodivým hrotem detekují kapacitní senzory, když se pipeta s něčím dotkne. Detekce kontaktu mezi kovovou sondou a deskou se používá v automatizovaných procesech kalibrace pipety a kalibrace modulu.
Jednokanálové pipety mají jeden kapacitní senzor, zatímco vícekanálové pipety mají dva: na kanálech 1 a 1 u 8kanálových pipet a na kanálech 8 a 1 (pozice A96 a H1) u 12kanálové pipety.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

SNÍMAČE PŘÍTOMNOSTI OPTICKÉHO KONCE
Spínač fotopřerušovače detekuje polohu mechanismu vyhazování špiček pipety a potvrzuje, zda byly špičky úspěšně zvednuty nebo upuštěny. 1-kanálové, 8-kanálové a 96kanálové pipety mají všechny jediný optický senzor, který monitoruje připevnění špičky ve všech kanálech.
Aktualizace firmwaru pipety
Opentrons Flex automaticky aktualizuje firmware pipety, aby byl synchronizován s verzí softwaru robota. Aktualizace firmwaru pipety jsou obvykle rychlé a vyskytují se vždy, když:
Připojíte pipetu. Robot se restartuje.
Pokud se z nějakého důvodu vaše verze firmwaru pipety a softwaru robota nesynchronizují, můžete firmware aktualizovat ručně v aplikaci Opentrons.
1. Klikněte na Zařízení. 2. Klikněte na svůj Flex v seznamu zařízení. 3. V části Instruments and Modules (Nástroje a moduly) se na nesynchronizované pipetě zobrazí nápis s varováním
"K dispozici je aktualizace firmwaru." Klepnutím na Aktualizovat nyní zahájíte aktualizaci.
Můžete view aktuálně nainstalovanou verzi firmwaru jakékoli připojené pipety. Na dotykové obrazovce přejděte na Nástroje a klepněte na název pipety. V aplikaci Opentrons najděte kartu s pipetou v části Instruments and Modules, klikněte na nabídku se třemi tečkami () a poté klikněte na O pipetě.

3.3 Chapadlo
Chapadlo pohybuje laboratorním nádobím po pracovní ploše a stagoblasti při provádění protokolů. Chapadlo se připojuje k prodlužovacímu držáku, který je oddělený od držáků na pipety; chapadlo lze použít s jakoukoli konfigurací pipety. Podrobnosti o instalaci chapadla viz Instalace a kalibrace přístroje.
Uchopovač může přesouvat laboratorní vybavení po palubě a na moduly nebo z nich. Uchopovač může manipulovat s určitými destičkami s plně obrubovanými jamkami, destičkami s hlubokými jamkami a stojany na špičky. Další podrobnosti o tom, s jakým labwarem může chapadlo pohybovat, najdete v části Labware a Opentrons Flex Gripper v kapitole Labware nebo se podívejte do Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

Specifikace chapadla
Čelisti vykonávají primární pohyb chapadla, kterým je otevření nebo zavření dvou paralelních lopatek pro působení nebo uvolňování síly na strany laboratorního nádobí. Pohyb čelistí je řízen kartáčovaným motorem 36 V DC připojeným k systému ozubené tyče s pastorkem.
Chcete-li přesunout kus laboratorního vybavení, který byl sevřen čelistmi, portál zvedne chapadlo podél osy z, posune jej do strany a poté jej spustí do nové polohy laboratorního vybavení.
Umístění součástí chapadla.

Upevňovací šrouby
Kalibrační čep Čelisti Paddles

Kalibrace chapadla
Součástí chapadla je kovový kalibrační kolík. Kalibrační kolík je umístěn v zapuštěné odkládací ploše na spodní části chapadla. Magnet drží špendlík na místě. Chcete-li vyjmout kalibrační kolík, uchopte jej prsty a jemně zatáhněte. Chcete-li kolík vyměnit, vložte jej zpět do úložného slotu. Budete vědět, že je v bezpečí, když zapadne na místo.
Při kalibraci chapadla připevněte kolík postupně ke každé čelisti. Robot přesune čep do kalibračních bodů na desce, aby změřil přesnou polohu chapadla.
Během běhu protokolu umístěte kolík do úložného prostoru pro bezpečné uchování. Pokud ztratíte kalibrační kolík, kontaktujte nás na adrese support@opentrons.com.

Aktualizace firmwaru gripperu
Opentrons Flex automaticky aktualizuje firmware chapadla, aby byl synchronizován s verzí softwaru robota. Aktualizace firmwaru gripperu jsou obvykle rychlé a vyskytují se vždy, když:

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU
Připevníte chapadlo. Robot se restartuje.
Pokud se z nějakého důvodu firmware vašeho chapadla a verze softwaru robota nesynchronizují, můžete firmware aktualizovat ručně v aplikaci Opentrons.
1. Klikněte na Zařízení. 2. Klikněte na svůj Flex v seznamu zařízení. 3. V části Instruments and Modules (Nástroje a moduly) se na nesynchronizovaném chapači zobrazí nápis s upozorněním
"K dispozici je aktualizace firmwaru." Klepnutím na Aktualizovat nyní zahájíte aktualizaci.
Můžete view aktuálně nainstalovanou verzi firmwaru chapadla. Na dotykové obrazovce přejděte na Nástroje a klepněte na chapadlo. V aplikaci Opentrons najděte kartu chapadla v části Instruments and Modules, klikněte na nabídku se třemi tečkami () a potom klikněte na položku O chapadla.
3.4 Přívěsek nouzového zastavení
Přívěsek nouzového zastavení (E-stop) je vyhrazené hardwarové tlačítko pro rychlé zastavení pohybu robota. Opentrons Flex vyžaduje, aby byl vždy připojen funkční odpojený E-stop. Když stisknete tlačítko stop, Flex co nejrychleji zruší jakýkoli běžící protokol nebo pracovní postup nastavení a zabrání většině pohybu robota.
Kdy použít E-stop
Možná budete muset stisknout E-stop:
Když hrozí bezprostřední riziko zranění nebo zranění uživatele. Když hrozí bezprostřední riziko poškození robota nebo jiného hardwaru. Když sampnebo reagencie jsou v bezprostředním nebezpečí kontaminace. Po hardwarové kolizi.
V ideálním případě byste nikdy neměli stisknout E-stop (s výjimkou občasného testování kvality hardwaru).
Nepoužívejte E-stop ke zrušení běžných očekávaných operací. Místo toho použijte softwarové tlačítko na dotykové obrazovce nebo v aplikaci Opentrons. Pozastavení pomocí softwaru vám umožní obnovit nebo zrušit váš protokol, zatímco stisknutím tlačítka E-stop se protokol vždy okamžitě zruší.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

Zapnutí a uvolnění nouzového zastavení
E-stop má mechanismus zatlačení, otočení a uvolnění.
Zajištění: Pevně zatlačte na červené tlačítko. Flex přejde do zastaveného stavu. Řešení: Po zastavení bezpečně vyřešte všechny problémy v pracovní oblasti, jako je odstranění rozlitých látek,
odstranění laboratorního vybavení nebo přemístění portálu (měl by se volně a snadno pohybovat rukou). Uvolnění: Otočte tlačítkem ve směru hodinových ručiček. Vyskočí do své uvolněné polohy. Reset: Na dotykové obrazovce nebo v aplikaci Opentrons potvrďte, že jste připraveni na obnovení Flex
pohyb. Portál se vrátí do své výchozí polohy a činnost modulu se obnoví.
V zastaveném stavu se Flex a připojený hardware budou chovat následovně:

Hardwarové portálové pipety
Uchopovač
Modul ohřívač-třepačka
Modul teploty Stavová kontrolka modulu termocykleru Dotyková obrazovka

Chování
Automatický horizontální pohyb je zastaven. Ruční horizontální pohyb je povolen.
Vertikální pohyb pipet je zastaven. Brzdy motoru na vertikálních osách jsou zapojeny, aby se zabránilo
pipety před pádem. Pohyb plunžru a uchopení hrotu je zastaveno.
Vertikální pohyb chapadla je zastaven. Brzda motoru na svislé ose je aktivována, aby se zabránilo
chapadlo před pádem. Čelisťové motory, které vyvíjejí uchopovací sílu, zůstávají aktivní, takže
chapadlo neupustí laboratorní nádobí, které může nést.
Šejkr se zastaví a vrátí se domů. Západka laboratorního softwaru se otevře. Topení je vypnuté.
Vyhřívání nebo chlazení je zakázáno.
Vyhřívání nebo chlazení je zakázáno.
Světlo zčervená.
Na obrazovce se objeví zpráva o zrušení. Když jste úspěšně provedli, zobrazí se na obrazovce indikátor
deaktivoval tlačítko stop.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU
3.5 Připojení

Vypínač zapnuto/vypnuto

Boční kryty

Porty USB-A

Vstup napájení IEC

Porty AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet

Připojení napájení
Opentrons Flex se připojuje ke zdroji energie přes standardní vstup IEC-C14. Robot obsahuje vnitřní AC/DC napájecí zdroj s plným rozsahem, který přijímá 100 VAC, 240/50 Hz vstup a převádí jej na 60 VDC. Veškerá ostatní vnitřní elektronika je napájena stejnosměrným napětím 36 V.

Varování: Používejte pouze napájecí kabel dodaný s robotem. Nepoužívejte napájecí kabel s nedostatečným proudem nebo voltage hodnocení.
Udržujte napájecí kabel bez překážek, abyste jej mohli v případě potřeby vyjmout.

K dispozici je také knoflíková baterie CR1220 pro napájení hodin reálného času robota, když není připojen k elektrické síti. Baterie je umístěna uvnitř krytu dotykové obrazovky. Pokud si myslíte, že potřebujete vyměnit baterii, kontaktujte podporu Opentrons pro více informací.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU
USB a pomocné připojení
Opentrons Flex má celkem 10 USB portů umístěných v různých oblastech robota, které slouží různým účelům.
8 zadních portů USB-A (číslované USB-1 až USB-8) a 2 pomocné porty (konektory M12 označené AUX-1 a AUX-2) slouží k připojení modulů Opentrons a příslušenství. Další informace o připojení těchto zařízení a jejich použití ve vašich protokolech naleznete v kapitole Moduly. Zadní port USB-B slouží k připojení robota k notebooku nebo stolnímu počítači, k navázání komunikace s aplikací Opentrons spuštěnou na připojeném počítači. Přední port USB-A (USB-9), umístěný pod dotykovým displejem, má stejné funkce jako zadní porty USB-A.
Poznámka: Porty USB mají omezený výkon, aby chránily robota a připojená zařízení. Napájení je interně rozděleno do tří skupin portů: levý zadní port USB-A (USB-1 až USB-4), pravý zadní port USB-A (USB-5 až USB-8) a přední USB-A přístav. Každá z těchto skupin dodá maximálně 500 mA do připojených zařízení kompatibilních s USB 2.0.
Síťová připojení
Opentrons Flex se může připojit k místní síti prostřednictvím kabelového (Ethernet) nebo bezdrátového (Wi-Fi) připojení.
Ethernetový port je umístěn na zadní straně robota. Připojte jej k rozbočovači Ethernet nebo zapněte síť. Nebo počínaje verzí robotického systému 7.1.0 jej připojte přímo k ethernetovému portu na vašem počítači. Interní Wi-Fi modul podporuje sítě 802.11 ac/a/b/g/n s dvoupásmovou 2.4/5 GHz anténou.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

3.6 Specifikace systému

Obecné specifikace

Rozměry Hmotnost Drážky paluby
Dotyková obrazovka
Wi-Fi Ethernet USB
Fotoaparát Příkon robota
Síťové napájení voltagkolísání e Kolísání frekvence síťového napájení Rozvodný systém Zkratový napájecí proud Skladba rámu Skladba oken Požadavky na větrání

87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 palců (Š, H, V)
88.5 kg / 195 lb 12 slotů kompatibilních s ANSI/SLAS v pracovní oblasti
(přístupné pro pipety) 4 další sloty pro staging tipů a laboratorního vybavení
(dostupný pouze pro chapadlo) 7palcový dotykový LCD displej s odolným sklem Gorilla Glass 3 odolným proti poškrábání a poškození
802.11 ac/a/b/g/n dvoupásmový (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 portů USB-A 1 port USB-B Rychlost USB 2.0
2MP, foto a video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10 %
±5 %
TN-S
6.3 A
Pevná ocel a CNC hliníkové provedení
Odnímatelná polykarbonátová boční okna a přední dveře Minimálně 20 cm / 8 mezi jednotkou a stěnou

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

Požadavky na připojený počítač

Aplikace Opentrons běží na: Windows 10 nebo novější macOS 10.10 nebo novější Ubuntu 12.04 nebo novější

Specifikace prostředí

Podmínky prostředí Teplota okolí Relativní vlhkost Stupeň znečištění

Pouze vnitřní použití +20 až +25 °C (doporučeno) 40 %, nekondenzující (doporučeno) 60 (pouze nevodivé znečištění)

Další informace o přijatelných podmínkách prostředí pro použití a přepravu naleznete v části Podmínky prostředí v kapitole Instalace a přemístění.

Certifikace

Certifikace kompletní Necertifikováno/ověřeno

CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP

Souhrn certifikačních informací je vytištěn na štítku na zadní straně Flex poblíž vypínače. Podrobné informace o certifikaci a shodě naleznete v části Soulad s předpisy v Úvodu.

Sériové číslo
Každý Flex má jedinečné sériové číslo. Formát sériového čísla poskytuje další informace, včetně data výroby robota. Napřample, sériové číslo FLXA1020231007001 by označovalo:

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 3: POPIS SYSTÉMU

Postavy FLX A10 2023 10 07 001

Kategorie Model Verze Rok Měsíc Den Jednotka

Význam Robot je Opentrons Flex. Kód pro produkční verzi robota. Robot byl vyroben v roce 2023. Robot byl vyroben v říjnu. Robot byl vyroben 7. den v měsíci. Jedinečné číslo pro roboty vyrobené v určitý den.

Sériové číslo svého Flex najdete:
Na certifikační nálepce na zadní straně Flex, poblíž vypínače. Na zadní straně dotykové obrazovky (směrem k pracovní oblasti). V aplikaci Opentrons v části Zařízení > váš Flex > Nastavení robota > Upřesnit.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4
Moduly
Opentrons Flex se integruje s řadou hardwarových modulů Opentrons. Všechny moduly jsou periferie, které zabírají sloty na palubě, a většinu z nich ovládá robot přes USB připojení.
Tato kapitola popisuje funkce a fyzické specifikace modulů, které jsou kompatibilní se systémem Opentrons Flex, a také způsob jejich připojení a kalibrace. Další podrobnosti o nastavení a použití modulu naleznete v manuálech k jednotlivým modulům. Podrobnosti o integraci modulů do vašich protokolů najdete v části Návrhář protokolů v kapitole Vývoj protokolu nebo v online dokumentaci Python Protocol API.
4.1 Podporované moduly
Opentrons Flex je kompatibilní se čtyřmi typy modulů Opentrons na palubě:
Modul Heater-Shaker poskytuje vytápění na palubě a orbitální protřepávání. Modul lze zahřát na 95 °C a může třepat sampod 200 do 3000 ot./min.
Magnetický blok je pasivní zařízení, které drží laboratorní vybavení v blízkosti svých vysoce pevných neodymových magnetů. Magnetický modul OT-2 GEN1 a GEN2, které aktivně pohybují svými magnety nahoru a dolů vzhledem k laboratornímu vybavení, nejsou na Opentrons Flex podporovány.
Teplotní modul je modul horké a studené desky, který je schopen udržovat ustálené teploty mezi 4 a 95 °C.
Modul termocykleru poskytuje plně automatizovanou termocyklaci na palubě, což umožňuje automatizaci kroků pracovního postupu před a po proudu. Termocykler GEN2 je plně kompatibilní s chapadlem. Termocykler GEN1 nelze použít s chapadlem, a proto není podporován na Opentrons Flex.
Některé moduly původně navržené pro OT-2 jsou kompatibilní s Flex, jak je shrnuto v tabulce níže. Zaškrtnutí označuje kompatibilitu a X označuje nekompatibilitu.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY

Typ a generace zařízení Modul ohřívače a třepačky Magnetický modul GEN1 Magnetický modul GEN1 Magnetický modul GEN2 Magnetický blok GEN1 Teplotní modul GEN1 Teplotní modul GEN2 Modul termocykléru GEN1 Modul termocykleru GEN2 Modul GENXNUMX HEPA Modul

OT-2

Flex

4.2 Modulový nosičový systém
Kompatibilní moduly jsou navrženy tak, aby se vešly do vozíků, které zabírají místo pod palubou. Tento systém umožňuje, aby laboratorní software na horní části modulů zůstal blíže k povrchu paluby, a také umožňuje vedení kabelů pod palubou, takže deska zůstane během běhu protokolu uklizená.

Nosiče pro moduly Heater-Shaker, Temperature a Thermocycler.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY
Aby se modul vešel na povrch paluby, musí být nejprve umístěn do odpovídajícího nosiče modulu. Každý typ kompatibilního modulu má svůj vlastní design nosiče, který přesně zarovná modul a laboratorní zařízení s okolní palubou. (Výjimkou je magnetický blok, který nevyžaduje vedení napájecího ani USB kabelu, a je tak umístěn přímo na povrchu paluby.) Nosiče pro moduly, které zabírají jeden slot, lze umístit kdekoli ve sloupci 1 nebo 3; termocykler lze umístit pouze do slotů A1 a B1 současně.
Obecně pro instalaci nosiče modulů:
1. Odstraňte všechny sloty z místa, kam modul půjde. 2. Usaďte modul do jeho nosiče a utáhněte jeho kotvy. 3. Protáhněte napájecí kabel modulu a kabely USB bočními kryty, nahoru skrz prázdnou štěrbinu a
připojte je k modulu. 4. Usaďte nosič modulu do slotu a přišroubujte jej na místo.
Přesné pokyny k instalaci naleznete v příručce pro rychlý start nebo v návodu k použití konkrétního modulu. Připojení kabelů a způsob připevnění ke vozíku se liší podle modulu.
4.3 Kalibrace modulu
Při první instalaci modulu na Flex musíte spustit automatickou kalibraci polohy. Tento proces je podobný poziční kalibraci pro přístroje a zajišťuje, že se Flex přesune na přesně správná místa pro optimální výkon protokolu. Během kalibrace se Flex přesune na místa na adaptéru pro kalibraci modulu, který vypadá podobně jako kalibrační čtverečky, které jsou součástí odnímatelných slotů.

Kalibrační adaptéry pro moduly Heater-Shaker, Temperature a Thermocycler.
Kalibrace modulu je vyžadována pro všechny moduly, které se instalují pomocí nosiče: moduly Heater-Shaker, Temperature a Thermocycler. Magnetický blok nevyžaduje kalibraci a je připraven k použití, jakmile jej umístíte na palubu.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY
Kdy kalibrovat moduly
Flex vás automaticky vyzve k provedení kalibrace, když připojíte a zapnete modul, který nemá uložená žádná kalibrační data. (Tuto výzvu můžete zavřít, ale nebudete moci spouštět protokoly s modulem, dokud jej nezkalibrujete.)
Jakmile dokončíte kalibraci, Flex uloží kalibrační data a sériové číslo modulu pro budoucí použití. Flex vás nevyzve k rekalibraci, pokud neodstraníte kalibrační data pro daný modul v nastavení robota. Modul můžete libovolně zapínat a vypínat, nebo jej dokonce přesunout do jiného slotu, aniž byste museli znovu kalibrovat. Pokud chcete provést rekalibraci, můžete proces kdykoli zahájit z karty modulu v aplikaci Opentrons. (Rekalibrace není dostupná z dotykové obrazovky.)
Jak kalibrovat moduly
Pokyny na dotykové obrazovce nebo v aplikaci Opentrons vás provedou postupem kalibrace. Obecně jsou tyto kroky:
1. Připravte si potřebné vybavení, včetně adaptéru pro kalibraci modulu a sondy pro kalibraci pipety. 2. Umístěte kalibrační adaptér na povrch modulu a ujistěte se, že je zcela vodorovný.
Některé moduly mohou vyžadovat upevnění adaptéru k modulu. 3. Připojte kalibrační sondu k pipetě. 4. Flex se automaticky přesune, aby se dotkl určitých bodů na kalibračním adaptéru a tyto body uloží
kalibrační hodnoty pro budoucí použití.
Po dokončení kalibrace a odstranění adaptéru a sondy bude modul připraven k použití v protokolech.
Kdykoli můžete view a spravovat data kalibrace modulu v aplikaci Opentrons. Přejděte do Nastavení robota pro váš Flex a klikněte na kartu Kalibrace.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY
4.4 Modul ohřívače-třepačky GEN1

Funkce Heater-Shaker
OHŘÍVÁNÍ A TŘEPÁNÍ
Heater-Shaker poskytuje vytápění na palubě a orbitální třepání. Modul lze zahřát na 95 °C s následující teplotou profile:
Teplotní rozsah: 37 °C Přesnost teploty: ±95 °C při 0.5 °C Rovnoměrnost teploty: ±55 °C při 0.5 °CRamp rychlost: 10 °C/min
Modul může třást sampméně od 200 do 3000 ot./min, s následujícím třesením profile:
Průměr oběžné dráhy: 2.0 mm Směr oběhu: Ve směru hodinových ručiček Rozsah otáček: 200 ot./min Přesnost otáček: ±3000 ot./min.
Modul má napájenou laboratorní západku pro zajištění desek k modulu před protřepáním.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY
TEPELNÉ ADAPTÉRY Pro přidání laboratorního vybavení do Heater-Shaker je vyžadován kompatibilní tepelný adaptér. Adaptéry lze zakoupit přímo od Opentrons na https://shop.opentrons.com. Aktuálně dostupné tepelné adaptéry zahrnují:

Univerzální plochý adaptér

PCR adaptér

Deep Well Adapter

96 Adaptér s plochým dnem

KONTROLA SOFTWARU
Heater-Shaker je plně programovatelný v Protocol Designer a Python Protocol API. Python API navíc umožňuje paralelní provádění dalších kroků protokolu, když je Heater-Shaker aktivní. Podrobnosti o přidávání paralelních kroků do vašich protokolů najdete v části Neblokující příkazy v dokumentaci API.
Mimo protokoly může aplikace Opentrons zobrazovat aktuální stav Heater-Shaker a může přímo ovládat ohřívač, třepačku a západku laboratorního vybavení.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY

Specifikace Heater-Shaker

Rozměry Hmotnost Příkon modulu Vstup napájecího adaptéru Napájení objtage fluktuace Overvoltage Spotřeba energie

152 × 90 × 82 mm (D/Š/V) 1.34 kg 36 V DC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60 % Kategorie II Idle: 10 W

Typické: Protřepávání: 4 W Zahřívání: 11 W Zahřívání a protřepávání: 10 W

Podmínky prostředí Teplota okolí Relativní vlhkost Nadmořská výška Stupeň znečištění

Maximum: 125 W Pouze vnitřní použití 130 °C Až 20 %, nekondenzující Až 25 80 m nad mořem 2,000

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY
4.5 Magnetický blok GEN1

Vlastnosti magnetického bloku
Opentrons Magnetic Block GEN1 je magnetický držák destiček s 96 jamkami. Magnetické bloky se používají v protokolech, které spoléhají na magnetismus k vytažení částic ze suspenze a jejich zadržení v destičkách s jamkami během promývání, oplachování nebo jiných elučních postupů. Napřample, automatizovaná příprava NGS; čištění genomové a mitochondriální DNA, RNA nebo proteinů; a další extrakční postupy jsou všechny případy použití, které mohou zahrnovat magnetické bloky.
MAGNETICKÉ KOMPONENTY
Magnetický blok je bez napájení, neobsahuje žádné elektronické součástky a nepohybuje magnetickými kuličkami nahoru ani dolů v roztoku. Jamky se skládají z 96 vysoce pevných neodymových prstencových magnetů připevněných k pružinovému lůžku, což pomáhá udržovat tolerance mezi blokem a pipetami při provozu automatizovaných protokolů.
KONTROLA SOFTWARU
Magnetický blok GEN1 je plně programovatelný v Protocol Designer a Python Protocol API.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY

Mimo protokoly však dotyková obrazovka a aplikace Opentrons neznají a nemohou zobrazit aktuální stav magnetického bloku GEN1. Toto je nenapájený modul. Neobsahuje elektronické ani mechanické součásti, které mohou komunikovat s robotem Flex. Magnetický blok „ovládáte“ pomocí protokolů, které používají Opentrons Flex Gripper k přidávání a odebírání laboratorního softwaru z tohoto modulu.

Specifikace magnetického bloku

Rozměry Hmotnost Výkon modulu Kvalita magnetu Podmínky prostředí Okolní teplota Relativní vlhkost Nadmořská výška Stupeň znečištění

136

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY
4.6 Teplotní modul GEN2

Vlastnosti teplotního modulu
TOPENÍ A CHLAZENÍ
Opentrons Temperature Module GEN2 je modul horké a studené desky. Často se používá v protokolech, které vyžadují zahřívání, chlazení nebo změny teploty. Modul může dosáhnout a udržovat teploty v rozmezí od 4 °C do 95 °C během několika minut, v závislosti na konfiguraci a obsahu modulu.
TEPELNÉ BLOKY
K udržení laboratorního vybavení při teplotě modul používá hliníkové tepelné bloky. Modul je dodáván s 24jamkovým a 96jamkovým tepelným blokem. Nosič teplotního modulu je dodáván s blokem hluboké studny a plochým spodním blokem určeným pro použití s Flex Gripper. Bloky obsahují zkumavky o objemu 1.5 ml a 2.0 ml, 96-jamkové PCR destičky, PCR stripy, destičky s hlubokými jamkami a destičky s plochým dnem.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY
Poznámka: Modul se také dodává s plochým spodním blokem pro OT-2. Nepoužívejte blok OT-2 s Flex. Plochý spodní blok pro Flex má na svém horním povrchu slova „Opentrons Flex“. Ten pro OT-2 ne.

24-jamkový tepelný blok

96-jamkový tepelný blok

Hluboký tepelný blok

Termoblok s plochým dnem pro Flex

VODNÍ LÁZNĚ A TOPENÍ
Protože vzduch je dobrým tepelným izolantem, mohou mezery mezi laboratorním vybavením a tepelným blokem ovlivnit výkon teplotního modulu v závislosti na teplotě. Umístění malého množství vody do 24- nebo 96-jamkových tepelných bloků eliminuje vzduchové mezery a zlepšuje účinnost vytápění. Ideální množství vody závisí na tepelném bloku a laboratorním vybavení. Další doporučení viz Bílá kniha o teplotním modulu.

KONTROLA SOFTWARU
Temperature Module je plně programovatelný v Protocol Designer a Python Protocol API.
Mimo protokoly může aplikace Opentrons zobrazit aktuální stav teplotního modulu a může přímo řídit teplotu povrchové desky.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY

Specifikace teplotního modulu

Rozměry Hmotnost Výkon modulu
Podmínky prostředí Teplota okolí Relativní vlhkost Nadmořská výška Stupeň znečištění

194 × 90 × 84 mm (D/Š/V) 1.5 kg Vstup: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Výstup: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W max Vnitřní použití pouze <219.6 °C (doporučeno pro optimální chlazení ) Až 22 %, nekondenzující Až 60 m nad mořem 2000

4.7 Modul termocykleru GEN2

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY
Vlastnosti termocykleru
Opentrons Thermocycler Module GEN2 je plně automatizovaný termocykler na palubě, který poskytuje hands-free PCR ve formátu 96jamkových destiček. Jeho vyhřívané víko a jednorázové těsnění těsně přiléhají k talíři a zajišťují efektivní sampzahřívání a minimální odpařování.
TOPENÍ A CHLAZENÍ Blok termocykleru se může zahřívat a chladit a jeho víko se může zahřívat s následující teplotou profile: Teplotní rozsah tepelného bloku: 4 °C Maximální ohřev tepelného bloku ramp rychlost: 4.25 °C/s od GEN2 okolí do 95 °C Maximální chlazení tepelného bloku ramp rychlost: 2.0 °C/s od 95 °C do okolní teploty Rozsah teploty víka: 37 °C Přesnost teploty víka: ±110 °C Automatické víko lze otevřít nebo zavřít podle potřeby během provádění protokolu.
THERMOCYCLER PROFILES Termocykler může provádět profiles: automatické cyklování sekvencí blokových teplot pro provádění reakcí citlivých na teplo.
PRYŽOVÁ TĚSNĚNÍ AUTOMATIZACE Termocykler se dodává s pryžovými automatickými těsněními, která pomáhají snižovat odpařování. Každé těsnění musí být před použitím sterilizováno a může být použito pro několik běhů. Další těsnění lze zakoupit přímo od společnosti Opentrons na adrese https://shop.opentrons.com.
SOFTWAROVÉ OVLÁDÁNÍ Termocykler je plně programovatelný v Protocol Designer a Python Protocol API. Mimo protokoly může aplikace Opentrons zobrazovat aktuální stav termocykleru a může přímo řídit teplotu bloku, teplotu víka a polohu víka.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 4: MODULY

Specifikace termocykleru

Rozměry (otevřené víko) Rozměry (zavřené víko) Hmotnost (včetně zadního potrubí) Napájecí adaptér objtage Proud napájecího adaptéru Overvoltage Podmínky prostředí Teplota okolí Relativní vlhkost Nadmořská výška Požadavky na ventilaci

244.95 × 172 × 310.1 mm (D/Š/V) 244.95 × 172 × 170.35 mm (D/Š/V) 8.4 kg 100 V při 240/50 Hz 60 A Kategorie II Pouze vnitřní použití (ideální 8.5 °C); 5 °C (přijatelné) 20 %, nekondenzující Až 25 m nad mořem Nejméně 2 cm / 40 mezi jednotkou a stěnou

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5
Labware
Tato kapitola pokrývá položky v knihovně Opentrons Labware Library, které můžete použít s Opentrons Flex a Opentrons Flex Gripper. Pokrývá také vlastní labware a pro naše pokročilé uživatele propojuje komponenty labwaru s jejich odpovídajícím JSON file definice.
Laboratorní software můžete zakoupit od výrobců originálního vybavení nebo v obchodě Opentrons na adrese https://shop.opentrons.com. A Opentrons vždy pracuje na ověřování nových definic labwaru. Nejnovější seznamy najdete v knihovně Labware (odkaz výše).
5.1 Pojmy Labware
Labware zahrnuje více než jen objekty umístěné na palubě a používané v protokolu. Abychom vám pomohli porozumět laboratornímu softwaru Opentrons, podívejme se na toto téma ze tří různých pohledů. U Opentrons Flex zahrnuje laboratorní software položky v naší knihovně Labware, data, která definují každý kus laboratorního softwaru, a vlastní laboratorní software.
Labware jako hardware
Knihovna Labware obsahuje vše, co můžete standardně používat s Opentrons Flex. Jedná se o odolné součásti a spotřební položky, se kterými pracujete, opakovaně je používáte nebo je likvidujete při spuštění protokolu. Pro práci s položkami v knihovně Labware nemusíte podnikat žádné zvláštní kroky. Robot Flex ví, jak automaticky pracovat se vším v knihovně.
Labware jako data
Informace o Labwaru jsou uloženy v objektové notaci Javascript (JSON) files s .json file rozšíření. JSON file zahrnuje prostorové rozměry (délka, šířka, výška), objemová kapacita (L, ml) a další metriky, které definují povrchové prvky, jejich tvary a umístění. Při spuštění protokolu čte Flex tyto .json fileabyste věděli, jaký laboratorní software je na palubě a jak s ním pracovat.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE
Vlastní laboratorní vybavení
Vlastní labware je labware, který není zahrnut v Labware Library nebo je labware vytvořený Custom Labware Creator. Někdy je však myšlenka vlastního laboratorního softwaru zatížena představami o složitosti, nákladech nebo obtížích. Vlastní laboratorní software by však neměl být těžké pochopit nebo vytvořit. Věnujme chvíli rozbalení konceptu vlastního laboratorního softwaru.
Jako exampOpentrons Labware Library obsahuje 96-jamkové destičky (200 l) od Corning a BioRad, ale tyto jamkové destičky vyrábějí i jiní výrobci. A díky běžně přijímaným průmyslovým standardům jsou rozdíly mezi těmito všudypřítomnými laboratorními položkami malé. Obyčejná 200 l, 96-jamková destička od Stellar Scientific, Oxford Lab nebo Krackeler Scientific (nebo jakéhokoli jiného dodavatele v tomto případě) je pro Flex „zakázkovým laboratorním softwarem“, protože není předdefinována v naší knihovně Labware. . Navíc drobné rozdíly v rozměrech laboratorního softwaru mohou mít drastický dopad na úspěšnost běhu vašeho protokolu. Z tohoto důvodu je důležité mít přesnou definici labwaru pro každý labware, který chcete ve svém protokolu použít.
Také, zatímco zakázkové laboratorní vybavení může být esoterickou, jednorázovou soupravou, většinou jsou to jen špičky, destičky, zkumavky a stojany používané každý den v laboratořích po celém světě. Opět, jediný rozdíl mezi Opentrons labware a custom labware je ten, že nová položka není předdefinována v softwaru, který pohání robota. Flex může a také pracuje s jinými základními laboratorními položkami nebo něčím jedinečným, ale musíte zaznamenat charakteristiky této položky v definici laboratorního softwaru JSON. file a importujte tato data do aplikace Opentrons. Další informace naleznete níže v části Definice vlastního labwaru.
Abych to shrnul, laboratorní software zahrnuje:
Vše v knihovně Opentrons Labware Library. Definice labwaru: data v JSON file která definuje tvary, velikosti a možnosti jednotlivých položek
jako jsou destičky, hroty, zásobníky atd. Vlastní laboratorní software, což jsou položky, které nejsou zahrnuty v knihovně Labware.
Po reviewNa základě těchto důležitých pojmů se podívejme na kategorie a položky v knihovně Opentrons Labware Library. Poté kapitolu dokončíme koncemview datových komponentů laboratorního softwaru file a shrnout funkce a služby Opentrons, které vám pomohou vytvořit vlastní laboratorní software.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

5.2 Nádrže
Opentrons Flex standardně pracuje s jedno- a vícejamkovými zásobníky uvedenými níže. Použití těchto nádrží pomáhá snížit vaši pracovní zátěž při přípravě, protože jsou připraveny na automatizaci ihned po vybalení. Informace o nádrži jsou také dostupné v Opentrons Labware Library.

Jednovrtné nádrže

Specifikace výrobce

Agilent

290 ml V dno

Axygen

90 ml s plochým dnem

HNÍZDO

195 ml s plochým dnem

290 ml V dno

Název načtení API
agilient_1_ zásobník_290ml
axygen_1_ zásobník_90ml
nest_1_ zásobník_195ml
nest_1_ zásobník_290ml

Vícejamkové nádrže

Specifikace výrobce

HNÍZDO

12 jamek 15 ml/jamka V dno

USA vědecký

12 jamek 22 ml/jamka V dno

Název zatížení API nest_12_ nádrž_15ml
usascientific_12_ zásobník_22ml

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE
Nádrže a definice API
Opentrons Labware Library definuje charakteristiky výše uvedených zásobníků v samostatném JSON files. Robot a Opentrons Python API spoléhají na tyto definice JSON při práci s laboratorním softwarem používaným vašimi protokoly. NapřampPři práci s rozhraním API přijímá funkce ProtocolContext.load_labware tyto názvy labwaru jako platné parametry ve vašem kódu. Názvy propojených zátěží API se připojují k definicím labwaru zásobníku v úložišti Opentrons GitHub.
Laboratorní vybavení na zakázku
Pokud zde není uveden zásobník, který byste chtěli použít, zkuste vytvořit vlastní definici labwaru pomocí Opentrons Labware Creator. Vlastní definice kombinuje všechny dimenze, metadata, tvary, objemovou kapacitu a další informace v JSON file. Opentrons Flex potřebuje tyto informace, aby pochopil, jak pracovat s vaším vlastním laboratorním softwarem. Další informace naleznete v části Definice vlastního labwaru.
5.3 Destičky s jamkami
Opentrons Flex standardně funguje s jamkovými destičkami uvedenými níže. Použití těchto destiček s jamkami pomáhá snížit vaši pracovní zátěž při přípravě, protože jsou připraveny na automatizaci ihned po vybalení. Informace o jamkové destičce jsou také dostupné v Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

6-jamkové destičky
Výrobce Corning

Specifikace
6 jamek 16.8 ml/jamka Kruhové jamky, ploché dno

Název zatížení API corning_6_wellplate_16.8ml_flat

12-jamkové destičky
Výrobce Corning

Specifikace
12 jamek 6.9 ml/jamka Kruhové jamky, ploché dno

Název zatížení API corning_12_wellplate_6.9ml_flat

24-jamkové destičky
Výrobce Corning

Specifikace
24 jamek 3.4 ml/jamka Kruhové jamky, ploché dno

Název zatížení API corning_24_wellplate_3.4ml_flat

48-jamkové destičky
Výrobce Corning

Specifikace
48 jamek 1.6 ml/jamka Kruhové jamky, ploché dno

Název zatížení API corning_48_wellplate_1.6ml_flat

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

96-jamkové destičky
Výrobce Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
USA vědecký

Specifikace
96 jamek 200 µl/jamka Kruhové jamky, V dno
96 jamek 360 µl/jamka Kruhové jamky, ploché dno
96 jamek 100 µl/jamka Kruhové jamky, V dolní část PCR plný plášť
96 jamek 200 µl/jamka Kruhové jamky, ploché dno
96 hlubokých jamek 2000 µL/jamka Čtvercové jamky, dno V
Pevné 96 jamek 200 µL/jamka Kruhové jamky, V dolní PCR plný plášť
Nunc 96 hlubokých jamek 1300 µL/jamka Kruhové jamky, U dno
Nunc 96 hlubokých jamek 2000 µL/jamka Kruhové jamky, U dno
96 hlubokých jamek 2.4 ml/jamka Čtvercové jamky, U dno

Název zatížení API biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nest_96_wellplate_200ul_flat
nest_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ sukně
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

384-jamkové destičky

Výrobce Applied Biosystems Bio-Rad
Corning

Specifikace
384 jamek 40 µl/jamka Kruhové jamky, V dno
384 jamek 50 µl/jamka Kruhové jamky, V dno
384 jamek 112 µL/jamka Čtvercové jamky, ploché dno

Název zatížení API applybiosystemsmicroamp_384_wellplate_40ul biorad_384_wellplate_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat

Adaptéry na desku studny
Níže uvedené hliníkové desky jsou tepelné adaptéry pro modul Opentrons Heater-Shaker GEN1. Tyto samostatné definice adaptérů můžete použít k načtení Opentrons ověřeného nebo vlastního laboratorního softwaru na horní část Heater-Shaker.

Typ adaptéru Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Adaptér Flat Bottom Heater-Shaker

Název zatížení API opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter

Můžete také načíst adaptér i labware s jedinou definicí. Naše knihovna Labware obsahuje několik předkonfigurovaných kombinací tepelného adaptéru a laboratorního softwaru, díky kterým je Heater-Shaker připraven k použití ihned po vybalení.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

Poznámka: Nepoužívejte kombinovanou definici, pokud potřebujete během protokolu přesunout laboratorní vybavení na ohřívač-Shaker nebo z něj, ať už pomocí chapadla nebo ručně. Místo toho použijte definici samostatného adaptéru.

Kombinace adaptéru a laboratorního softwaru

Název načtení API

Adaptér Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker s Deep Well Plate NEST 2 ml

opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep

Opentrons 96 adaptér ohřívače a třepačky s plochým dnem s 96jamkovou destičkou NEST 200 µl plochý

opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat

Opentrons 96 PCR Heater-Shaker adaptér s jamkovou destičkou NEST 100 µl

opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt

Univerzální adaptér plochého ohřívače a třepačky Opentrons s 384jamkovou destičkou Corning 112 µl plochý

opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat

Adaptéry lze zakoupit přímo od Opentrons na https://shop.opentrons.com.

Jamkové destičky a definice API
Opentrons Labware Library definuje charakteristiky jamkových destiček uvedených výše v samostatném JSON files. Robot Flex a Opentrons Python API spoléhají na tyto definice JSON při práci s laboratorním softwarem používaným vašimi protokoly. NapřampPři práci s rozhraním API přijímá funkce ProtocolContext.load_labware tyto názvy labwaru jako platné parametry ve vašem kódu. Názvy propojených zátěží API se připojují k definicím laboratorního softwaru jamkové destičky v úložišti Opentrons GitHub.

Zakázkové laboratorní nádobí
Pokud zde není uvedena jamková destička, kterou byste chtěli použít, zkuste použít Opentrons Labware Creator k vytvoření vlastní definice laboratorního softwaru. Vlastní definice kombinuje všechny dimenze, metadata, tvary, objemovou kapacitu a další informace v JSON file. Opentrons Flex čte tyto informace, aby pochopil, jak pracovat s vaším vlastním laboratorním softwarem. Další informace naleznete v části Definice vlastního labwaru.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

5.4 Špičky a stojany na špičky
Špičky Opentrons Flex se dodávají ve velikostech 50 µL, 200 µL a 1000 µL. Jedná se o čiré, nevodivé polypropylenové hroty, které jsou k dispozici s filtry nebo bez nich. Jsou sterilně baleny ve stojanech, které obsahují 96 špiček a jsou bez DNázy, RNázy, proteázy, pyrogenů, lidské DNA, endotoxinů a inhibitorů PCR. Stojany také obsahují čísla šarží a data expirace.
Špičky pipet Flex fungují s pipetami Opentrons Flex 50 µL a 1000 µL v 1-, 8- a 96-kanálové konfiguraci. I když můžete na 50 l a 1000 XNUMX l pipety nasadit kteroukoli z Flex špiček, snažte se špičku přizpůsobit jmenovité kapacitě pipety. Napřample, může být divné nasadit 1000 l špičku na 50 l pipetu. Pro 1000 l pipetu byste jistě mohli použít 50 l, 200 l nebo 1000 XNUMX l špičku.

Stojany na špičky
Nefiltrované a filtrované špičky jsou svázány do stojanu, který se skládá z opakovaně použitelné základní desky, střední desky, která pojme 96 špiček, a víka.

Stojan na špičky podle objemu 50 µL 200 µL 1000 µL

Název načtení API
Nefiltrováno: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Filtrováno: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Nefiltrováno: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Filtrováno: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Nefiltrováno: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Filtrováno: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul

Pro usnadnění identifikace jsou střední destičky stojanu na špičky barevně označeny podle velikosti špičky:
50 ul: purpurová 200 l: žlutá 1000 ul: modrá

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

Při objednávání nebo přeobjednávání se hroty a stojany dodávají ve dvou různých balených konfiguracích:
Stojany: Skládají se ze samostatně smrštitelných stojánků na špičky (základní deska, střední deska se špičkami a víko). Rackové konfigurace jsou nejlepší, když je čistota prvořadá, aby se zabránilo křížové kontaminaci, nebo když vaše protokoly neumožňují opětovné použití základní desky nebo součásti.
Náplně: Skládají se z jednoho kompletního stojanu na špičky (základní deska, střední deska se špičkami a víkem) a jednotlivých nádob na špičky. Konfigurace doplňování jsou nejlepší, když vaše protokoly umožňují opětovné použití základní desky nebo součásti.
Kompatibilita s tryskami
Špičky na pipety Flex jsou určeny pro pipety Opentrons Flex. Špičky Flex nejsou zpětně kompatibilní s pipetami Opentrons OT-2, ani nemůžete používat špičky OT-2 na pipetách Flex.
S pipetami Flex mohou fungovat i jiné průmyslové standardní špičky, ale to se nedoporučuje. Pro zajištění optimálního výkonu byste měli používat pouze špičky Opentrons Flex s pipetami Flex.
Adaptér držáku špiček
96kanálová pipeta vyžaduje adaptér pro správné připojení plného stojanu na špičky. Během připevňovacího postupu se pipeta přesune přes adaptér, spustí se na montážní kolíky a natáhne špičky na pipety zvednutím adaptéru a stojanu na špičky.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

Poznámka: Adaptér stojanu na špičky používejte pouze při sbírání plného stojanu na špičky najednou. Když sbíráte méně špiček, umístěte stojany na špičky přímo na desku.
Varování: Nebezpečí přiskřípnutí. Držte ruce mimo adaptér stojanu na špičky, když pipeta připojuje špičky pipet.

Typ adaptéru Opentrons Flex 96 Tip Rack adaptér

Název načtení API opentrons_flex_96_tiprack_adapter

Adaptér stojanu na špičky je kompatibilní s Opentrons Flex Gripper. Uchopovač můžete použít k umístění stojanů na čerstvé špičky na adaptér nebo k vyzvednutí a přesunutí použitých stojanů na špičky do odpadního skluzu.

5.5 Zkumavky a stojany na zkumavky

Systém Opentrons 4-v-1 Tube Rack standardně funguje s Opentrons Flex. Použití stojanu na zkumavky 4 v 1 pomáhá snížit vaši pracovní zátěž při přípravě, protože kombinace, které poskytuje, jsou připraveny na automatizaci ihned po vybalení. Více informací je také k dispozici v Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE
Kombinace trubek a stojanů
Stojan na zkumavky Opentrons 4 v 1 podporuje širokou škálu velikostí zkumavek, jednotlivě nebo v různých kombinacích velikostí (objemů). Patří mezi ně: Stojan na 6 zkumavek pro 50 ml zkumavky (6 x 50 ml). Kombinovaný stojan s 10 zkumavkami pro čtyři zkumavky 50 ml a šest zkumavek 15 ml (4 x 50 ml, 6 x 15 ml). Stojan na 15 zkumavek pro 15 ml zkumavky (15 x 15 ml). Stojan s 24 zkumavkami pro zkumavky 0.5 ml, 1.5 ml nebo 2 ml (24 x 0.5 ml, 1.5 ml, 2 ml).
Poznámka: Všechny trubky jsou válcové s dnem ve tvaru V (kónické), pokud není uvedeno jinak.

6-trubkové stojany
Typ zkumavky 6 Falcon 50 ml 6 NEST 50 ml
10-trubkové stojany
Typ zkumavky 4 Falcon 50 ml 6 Falcon 15 ml 4 NEST 50 ml 6 NEST 15 ml

Název zatížení API opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

15-trubkové stojany
Typ zkumavky 15 Falcon 15 ml 15 NEST 15 ml

Název zatížení API opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical

24-trubkové stojany

Typ trubky
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 ml 24 Eppendorf Safe-Lock 2 ml, dno ve tvaru U 24 generický 2 ml šroubovací uzávěr 24 NEST 0.5 ml šroubovací uzávěr 24 NEST 1.5 ml šroubovací uzávěr 24 NEST 1.5 ml šroubovací uzávěr 24 NEST 2 ml šroubovací uzávěr 24 NEST 2 ml zaklapávací uzávěr, dno ve tvaru U

Název načtení API opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap

Definice API stojanu na trubky
Opentrons Labware Library definuje charakteristiky stojanů na zkumavky uvedené výše v samostatném JSON files. Robot Flex a Opentrons Python API spoléhají na tyto definice JSON při práci s laboratorním softwarem používaným vašimi protokoly. NapřampPři práci s rozhraním API přijímá funkce ProtocolContext.load_labware tyto názvy labwaru jako platné parametry ve vašem kódu. Názvy propojených zátěží API se připojují k definicím laboratorního softwaru stojanu v úložišti Opentrons GitHub.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE
Zakázkový laboratorní stojan na trubky
Pokud zde není uvedena kombinace zkumavek a stojanu, kterou byste chtěli použít, zkuste vytvořit vlastní definici labwaru pomocí Opentrons Labware Creator. Vlastní definice kombinuje všechny dimenze, metadata, tvary, objemovou kapacitu a další informace v JSON file. Opentrons Flex čte tyto informace, aby pochopil, jak pracovat s vaším vlastním laboratorním softwarem. Další informace naleznete v části Definice vlastního labwaru.
5.6 Hliníkové bloky
Hliníkové bloky se dodávají s teplotním modulem GEN2 a lze je zakoupit samostatně jako třídílnou sadu. Sada obsahuje destičku s plochým dnem, 24-jamkový blok a 96-jamkový blok.
Opentrons Flex používá hliníkové bloky k držení sampZkumavky a destičky s jamkami umístěte na teplotní modul nebo přímo na palubu. Při použití s teplotním modulem mohou hliníkové bloky udržet vaše sampzkumavky, PCR stripy nebo destičky při konstantní teplotě mezi 4 °C a 95 °C.
Plochá spodní deska
Plochá spodní deska pro Flex se dodává s nosičem teplotního modulu a je kompatibilní s různými standardními jamkovými deskami ANSI/SLAS. Tato plochá deska se liší od desky dodávané se samotným teplotním modulem nebo samostatnou třídílnou sadou. Má širší pracovní plochu a zkosené rohové spony. Tyto funkce pomáhají zlepšit výkon Opentrons Flex Gripper při přesunu laboratorního vybavení na desku nebo z ní.
Můžete zjistit, jakou plochou spodní desku máte, protože deska pro Flex má na horním povrchu nápis „Opentrons Flex“. Ten pro OT-2 ne.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

24jamkový hliníkový blok
24jamkový blok se používá s jednotlivými sample lahvičky. Napřample, přijímá sample lahvičky, které:
Mají dna ve tvaru V nebo U. Zajistěte obsah zaklapávacím uzávěrem nebo šroubovacím uzávěrem. Udržujte kapalinu v kapacitách 0.5 ml, 1.5 ml a 2 ml.

96jamkový hliníkový blok
Blok s 96 jamkami podporuje širokou škálu typů destiček s jamkami. Napřample, přijímá dobře destičky, které jsou:
Od hlavních výrobců talířů, jako jsou Bio-Rad a NEST.
Navrženo se dnem ve tvaru V, dnem ve tvaru U nebo plochým dnem.
Navrženo s jamkami o objemu 100 µL nebo 200 µL.
Je také kompatibilní s generickými PCR stripy.

Samostatné adaptéry
Termoblok Flex s plochým dnem 24jamkový hliníkový blok 96jamkový hliníkový blok

Název načtení API opentrons_aluminium_flat_bottom_plate Viz kombinace labwaru níže. opentrons_96_well_aluminium_block

Kombinace hliníkových blokových laboratorních přístrojů
Opentrons Labware Library podporuje následující kombinace bloků, lahviček a jamkových destiček, které jsou také definovány v samostatné definici laboratorního softwaru JSON files. Robot Flex a Opentrons Python API

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE
Spolehněte se na tyto definice JSON při práci s laboratorním softwarem používaným vašimi protokoly. NapřampPři práci s rozhraním API přijímá funkce ProtocolContext.load_labware tyto názvy labwaru jako platné parametry ve vašem kódu. V tabulkách níže jsou uvedeny výchozí kombinace bloků/kontejnerů a související názvy zatížení API. Odkazy se připojují k odpovídajícím definicím JSON v úložišti Opentrons GitHub.
Poznámka: Všechny zkumavky mají dna ve tvaru V, pokud není uvedeno jinak.

24-jamkové kombinace hliníkových bloků

Obsah 24jamkového bloku Obecný 2ml šroubovací uzávěr NEST 0.5ml šroubovací uzávěr NEST 1.5ml šroubovací uzávěr NEST 1.5ml západkový uzávěr NEST 2ml šroubovací uzávěr NEST 2ml západkový uzávěr, dno ve tvaru U

Název zatížení API opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nestluminnapml_crest_nest_1.5ml uzávěr opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml_snapcap

96-jamkové kombinace hliníkových bloků

Obsah 96jamkového bloku Bio-Rad jamková destička 200 µL Generic PCR strip 200 µL NEST jamková destička 100 µL

Název zatížení API opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

5.7 Labware a Opentrons Flex Gripper
Ačkoli Opentrons Flex pracuje s veškerým inventářem v Labware Library, Opentrons Flex Gripper je kompatibilní pouze s konkrétními položkami labwaru. V současné době je Gripper optimalizován pro použití s následujícími položkami laboratorního softwaru.

Kategorie laboratorního vybavení Deep Well Plates Plně obložené 96jamkové destičky
Stojany na špičky (nefiltrované a filtrované špičky)

Značky
NEST 96 Deep Well Plate 2 ml
Tvrdá 96jamková destička Opentrons 200 µL PCR Full Skirt NEST 96jamková destička 200 µL plochá
Stojan na hroty Opentrons Flex 96 50 µL Stojan na hroty Opentrons Flex 96 200 µL Stojan na hroty Opentrons Flex 96 1000 µL

Poznámka: Pro dosažení nejlepších výsledků používejte Flex Gripper pouze s výše uvedeným laboratorním vybavením. Flex Gripper může pracovat s jiným laboratorním softwarem vyhovujícím ANSI/SLAS automatizaci, ale to se nedoporučuje.

5.8 Vlastní definice labwaru
Jak bylo uvedeno na začátku této kapitoly, vlastní labware je labware, který není uveden v Opentrons Labware Library. S Flex můžete používat další běžné nebo jedinečné laboratorní položky, a to přesným měřením a záznamem charakteristik daného objektu a uložením těchto dat do JSON. file. Při importu do aplikace používá Flex a API tato data JSON k interakci s vaším laboratorním softwarem. Opentrons poskytuje nástroje a služby, které prozkoumáme níže, které vám pomohou používat Flex s vlastním laboratorním softwarem.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

Vytváření vlastních definic labwaru
Nástroje a služby Opentrons vám pomohou umístit vlastní laboratorní software na dosah. Tyto funkce odpovídají různým úrovním dovedností a způsobům práce. Vytvoření vlastního laboratorního softwaru a jeho používání s Opentrons Flex pomáhá učinit z robota všestranný a výkonný doplněk do vaší laboratoře.

Tvůrce LABWARE NA MÍRU
Custom Labware Creator je bez kódu, web-založený nástroj, který používá grafické rozhraní, které vám pomůže vytvořit definici laboratorního softwaru file. Labware Creator vytváří definici labwaru JSON file které importujete do aplikace Opentrons. Poté je váš vlastní laboratorní software k dispozici robotu Flex a rozhraní Python API.

SLUŽBY LABWARE NA MÍRU
Kontaktujte nás, pokud laboratorní software, který byste chtěli použít, není k dispozici v knihovně, pokud si nemůžete vytvořit vlastní definice nebo protože vlastní položka obsahuje různé tvary, velikosti nebo jiné nepravidelnosti popsané níže.

Labware můžete definovat v Labware Creator
; Jamky a zkumavky jsou jednotné a identické. ; Všechny řádky jsou rovnoměrně rozmístěny
(mezera mezi řádky je stejná).
; Všechny sloupce jsou rozmístěny rovnoměrně (mezera mezi sloupci je stejná).
; Perfektně se vejde do jednoho slotu na palubě.

Labware Opentrons potřebuje definovat ; Tvary jamek a trubek se liší. ; Řádky nejsou rovnoměrně rozmístěny.
; Sloupce nejsou rovnoměrně rozmístěny.
; Menší než jeden slot na palubě (vyžaduje adaptér) nebo zahrnuje více slotů na palubě.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE
Zde je několik diagramů, které vám pomohou představit si exampvýše popsané. Pravidelné Všechny sloupce jsou rozmístěny rovnoměrně a všechny řádky jsou rovnoměrně rozmístěny. Sloupce nemusí mít stejné rozestupy jako řádky.
Normální Mřížka nemusí být ve středu laboratorního vybavení.
Nepravidelné řádky jsou rozmístěny rovnoměrně, ale sloupce nejsou rovnoměrně rozmístěny.
Nepravidelné Sloupce/řady jsou rovnoměrně rozmístěny, ale jamky nejsou totožné.
Nepravidelné Existuje více než jedna mřížka.
Náš laboratorní tým bude pracovat na tom, aby porozuměl vašim potřebám a navrhl pro vás vlastní definice laboratorního softwaru. Další informace naleznete v článcích podpory Požadavek na definici vlastního labwaru a ve formuláři Žádost o vlastní labware. Jedná se o placenou službu.

OPENTRONS FLEX

KAPITOLA 5: LABWARE

PYTHON API
I když nemůžete vytvořit vlastní laboratorní software pomocí našeho API, můžete použít vlastní laboratorní software s dostupnými metodami API. Nejprve však musíte definovat svůj vlastní laboratorní software a importovat jej do aplikace Opentrons. Jakmile přidáte svůj laboratorní software do aplikace Opentrons, je k dispozici pro Python API a robot. Další informace naleznete v části Definice vlastního labwaru v dokumentaci rozhraní Python API. Informace o psaní protokolových skriptů pomocí API najdete v části Python Protocol API v kapitole Vývoj protokolu.
Schéma laboratorního softwaru JSON
JSON file je plán pro standardní a vlastní laboratorní software Opentrons. Tento file obsahuje a organizuje data laboratorního softwaru podle specifikací návrhu nastavených výchozím schématem.
Schéma je rámec

Dokumenty / zdroje

opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Open Source robot pro manipulaci s kapalinami [pdfNávod k obsluze
FLEX Opentrons Flex Open Source robot pro manipulaci s kapalinami, FLEX, Opentrons Flex Open Source robot pro manipulaci s kapalinami, Flex Open Source robot pro manipulaci s kapalinami, Open Source robot pro manipulaci s kapalinami, Robot pro manipulaci se zdrojovými kapalinami, robot pro manipulaci s kapalinami, manipulační robot, robot

Reference

Uživatelská příručka

FLEX Opentrons Flex Open Source robot pro manipulaci s kapalinami

Opentrons Flex

Specifikace:

Návod k použití produktu:

1. Instalace a kalibrace přístroje:

2. Přemístění:

3. Připojení:

4. Návrhář protokolu:

5. Python Protocol API:

6. Protokoly OT-2:

Často kladené otázky (FAQ):

Otázka: Jak mohu odstranit problémy, pokud se robot nepohybuje jako?
očekávaný?

Otázka: Mohu s Opentrons Flex používat vlastní pipety?

Dokumenty / zdroje

Reference

Zanechte komentář

Zrušit odpověď

FLEX Opentrons Flex Open Source robot pro manipulaci s kapalinami

Opentrons Flex

Specifikace:

Návod k použití produktu:

1. Instalace a kalibrace přístroje:

2. Přemístění:

3. Připojení:

4. Návrhář protokolu:

5. Python Protocol API:

6. Protokoly OT-2:

Často kladené otázky (FAQ):

Otázka: Jak mohu odstranit problémy, pokud se robot nepohybuje jako? očekávaný?

Otázka: Mohu s Opentrons Flex používat vlastní pipety?

Dokumenty / zdroje

Reference

Související příspěvky

Zanechte komentář

Zrušit odpověď

Otázka: Jak mohu odstranit problémy, pokud se robot nepohybuje jako?
očekávaný?